支气管结核的检查包括细菌学检查、纤支镜检查、聚合酶链反应及影像学检查，其具体检查方法如下所述。
一、细菌学检查
常规痰抗酸染色镜检阳性率4.3％～68.8％，多数报道在30％以下。痰结核分支杆菌培养阳性率10.7％～100％，儿童胃液结核分支杆菌培养阳性率较高。细菌学检查阳性率不高的原因可能是多方面的，如引流支气管不通畅、含有结核分支杆菌的坏死物不易排出体外或毛刷不易刷到结核性分泌物、痰含菌量少、病灶为粘膜下浸润、增殖病灶处于相对静止状态、病例选择和检测方法不同等。近年有人提出在纤支镜直视下用直径2mm硅胶管深入病变的亚段细支气管吸取分泌物做厚涂片检查，阳性率可达20.8％。采用毛刷涂片，支气管冲洗液涂片培养，术后痰涂片均是痰细菌学检查的良好补充。不同采样标本，不同检测方法联合应用可提高支气管结核（EBTB）的阳性检出率。
二、组织、细胞学检查
经纤支镜支气管内采样做组织、细胞学检查是诊断EBTB最重要的手段，对细菌学检查阴性的EBTB诊断价值更大。EBTB常见的镜下表现为粘膜肥厚狭窄（43％）、充血水肿（20.6％）、糜烂溃疡（18.2％）、疤痕狭窄（18.2％），不同程度的狭窄可达90％以上。但肉眼观察无法做出正确诊断。组织病理学改变主要是干酪样、非干酪样肉芽肿，有类上皮细胞、淋巴细胞浸润。典型改变仅占36％，艾滋病（AIDS）合并EBTB者缺乏结核性肉芽肿的特征性改变。EBTB细胞学特征是坏死较为彻底，坏死物水分少，含脂多，易干燥呈颗粒状。结核结节周围无游离的纤毛柱状细胞，纤毛柱状细胞排列仍有极性，游离缘清晰，柱状结构存在，核呈桑椹样排列。上述特征不同于肿瘤凝固性坏死和异物型多核巨细胞。细胞学检查阳性率并不低于细菌学检查，在一定程度上可弥补细菌学检出率低的不足。
三、聚合酶链反应
聚合酶链反应（PCR）及免疫学技术：有关报道不太多。PCR有很好的诊断价值，检测组织标本中结核分支杆菌DNA是先进的技术方法，应用前景看好。聚合酶链原位扩增法检测肺石蜡切片中结核分支杆菌DNA，阳性区域有杆、棒状或点状深蓝色小体存在。巢式聚合酶链反应（NPCR）检测活组织中结核分支杆菌DNA，该法用内引物和第二次放大时循环次数少，结果减少背景带增加了特异性。最后产物以内引物特异性为基础放大，克服了污染。对于胸片正常，痰菌阴性，组织学未见典型结核改变的EBTB颇有诊断价值。
四、影像学检查
1、EBTB的X线胸片表现各异，与支气管、肺、胸膜和纵隔病变密切相关。肺斑片状浸润影占29％～41％，肺不张28％～49％，肺实变36％，肺内非活动性病灶13％～33％，空洞26％，肺门影增大8％～15.8％，胸腔积液5.3％，毁损肺5.2％，胸片未见异常者3％～40％。
2、EBTB的CT特征
（1）两肺上叶、中、舌叶是结核好发部位。
（2）受累支气管病变广泛，74％为多支受累。
（3）有支气管狭窄、管壁增厚、梗阻。
（4）78％有肺结核，有肺门淋巴结肿大。
（5）多数支气管引流的肺叶、段近端肺门层面无肿大及局部外突。
增强扫描显示有淋巴结环状强化或实变不张的肺组织中无肺门肿块，更支持本病的诊断。CT表现取决于病期，活动性病变时，气道管壁不规则增厚，而慢性纤维性病变时，气道为光滑性狭窄和轻度管壁增厚，动态观察无明显变化。