1.遗传
遗传因素对孤独症的作用已趋于明确，但具体的遗传方式还不明了。
2.围产期因素
围产期各种并发症，如产伤、宫内窒息等较正常对照组多。
3.免疫系统异常
发现T淋巴细胞数量减少，辅助T细胞和B细胞数量减少、抑制-诱导T细胞缺乏、自然杀伤细胞活性减低等。
4.神经内分泌和神经递质
与多种神经内分泌和神经递质功能失调有关。研究发现孤独症患者的单胺系统，如5-羟色胺(5-HT)和儿茶酚胺发育不成熟，松果体-丘脑下部-垂体-肾上腺轴异常，导致5-HT、内啡肽增加，促肾上腺皮质激素(ACTH)分泌减少。
自闭症病因有哪些？
1.与遗传有关;这个结论是通过一些数据分析得出来的。自闭症语言障碍患者的男女比例一般都维持在4:1的比例上。同时，有些自闭症语言障碍家族，这些家族患自闭症语言障碍的比例要高于其他正常家族。种种迹象表明，自闭症语言障碍与遗传有着密不可分的关系。但是，以现在科学技术，还未能找到导致自闭症出新的遗传基因，所以我们只能从这些自闭症治疗数据和一些试验中，找出自闭症的成因。
2.对自闭症的成因误解;自闭症最早被定义为精神疾病，被划分到精神分裂疾病中，而随着研究的深入很多人把自闭症的成因归结于母亲。这儿所说的冰箱母亲，指的是那些整天忙于工作，孩子的生长不关心的家长，人们认为孩子正是由于得自闭症，由于没有出色的生活环境而发生的心理歪曲。但这个说法很快就被人批驳倒了。一位生物学家经过分析发现,自闭症属于一种先天性的疾病,及自闭症小儿在出生时,就已经带有自闭症的患病因素,只不过这种病症,会在患者2岁左右时,才有明显的症状。
