严重肾病、尿路畸形、保留导尿患者严重肾病、尿路畸形或进行尿路器械操作而并发败血症时宜给予氨苄西林或哌拉西林并联合庆大霉素静脉给药。由多种耐药革兰阴性杆菌所致尿路感染，也可选用新一代头孢菌素如头孢噻肟、头孢呋新等药物。患者肾功能减退时应调整给药剂量。
保留导尿病人仅有菌尿症而无症状时不需治疗，出现全身症状时应予氨苄西林或哌拉西林，也可联合应用庆大霉素，或根据药敏选用药物，同时拔除导尿管或间歇导尿。长程服药预防感染有助于耐药菌株的产生，不宜采用。
菌尿症成人无症状性菌尿可自行消失，但在孕妇和小儿则有发展为症状性尿路感染可能，应予以治疗，一般口服抗菌药物2周，以后定期随访尿培养观察有无复发。
妊娠期尿路感染妊娠期易发生尿路感染及菌尿症，均宜给予抗菌治疗;药物的选用需兼顾母亲及胎儿，毒性较大的氨基糖甙类不宜应用，喹诺酮类亦应避免，妊娠后期不宜用磺胺药及氯霉素。可选用氨苄西林、阿莫西林、头孢菌素类和磷霉素等。
婴幼儿尿路感染婴幼儿尿道短而宽;易被粪便污染，又常存在膀胱输尿管返流而致上行感染，故发病率高。患儿年龄越小，临床表现越不典型，必要时可作耻骨上膀胱穿刺取尿作培养以明确诊断。药物可选用氨苄西林、复方磺胺甲噁唑和呋喃妥因，不宜用喹诺酮类。
老年人尿路感染老年患者常伴肾功能减退，毒性大的氨基糖甙类药物宜慎用，主要经肾排泄的抗菌药物需酌情减量应用。老年男性由于存在前列腺肥大或前列腺炎，故尿路感染更为常见。
