肾结核的实验室检查和影像学检查分别具有如下特点：
一、实验室检查
1、尿常规
约90％的患者可发现尿液异常，尿一般呈酸性，镜下脓尿和血尿最为常见，伴少量尿蛋白质，尿常规检查是早期筛选肾结核的重要线索。
2、结核菌检测
取24h尿或晨间第1次尿沉淀物直接涂片作抗酸染色检测是否含有结核菌，连查3次，50％～70％的患者可查到结核菌，但需注意，若涂片阳性，也不能完全确定，因耻垢杆菌或其他耐酸杆菌可以污染尿液，从形态学上难以与结核分支杆菌区别，导致假阳性，尤其不能依靠1次阳性结果来诊断，故收集尿液标本时应将外阴及尿道口洗净避免污染，检查前1周应停用所有抗结核药物，以提高尿检的阳性率。
3、尿结核菌培养
这是诊断肾结核的重要依据，并可进行细菌耐药性监测，一般认为晨尿标本优于24h尿，因晨尿易于收集且污染机会较少，但由于结核菌向尿中排泄是间隙性的，故在应用抗结核治疗前至少留3天晨尿做结核菌培养，其阳性率可达80％～90％，有些学者提出收集6次晨尿培养更好。
4、免疫学检测
该诊断是根据抗原抗体间的特异性反应原理，以检测血清及尿中的抗原、抗体及抗原抗体复合物，有助结核病的诊断。常用检测方法有放免测定法(RIA)及酶联免疫吸附试验(ELISA)。
二、影像学检查
尿中查到结核杆菌虽可明确肾结核的诊断，但具体病变的位置，范围的大小，单侧抑或双侧以及治疗方案的选择均有赖于进一步影像学检查。
1、平片
泌尿系平片可观察双肾轮廓、大小、位置，腰大肌的影像以及肾、输尿管、膀胱有无结石、钙化或异物，肾结核钙化多不规则，密度不均，干酪空洞型结核常见围绕空洞壁钙化，呈圆形或半圆形，多位于肾实质，除非有广泛的肾脏钙化，结核性输尿管钙化非常少见，应与埃及血吸虫病相鉴别，前者为输尿管腔内的钙化，输尿管增粗而并不扩张；而埃及血吸虫病为输尿管管腔钙化，通常有输尿管扩张和扭曲，有时腰大肌脓肿钙化可与肾脏钙化相混淆，可进行静脉尿路造影以进一步明确诊断。