内镜检查较为特征性的镜下所见有：
1、食管黏膜有浅在鼠啮状溃疡，基底呈灰白色，有渗出物，局部水肿。
2、食管黏膜上可有多个黄色的隆起状肉芽组织，即所谓结核球，软而脆，但不易出血。
3、增殖型可见黏膜充血，黏膜上有较多微小黄色赘疣覆盖。
4、当有食管气管瘘时，则可见瘘口，咳嗽时可有气体或分泌物自瘘口溢出。
5、通过活体组织学检查可见到肉芽肿，抗酸染色可发现抗酸杆菌（acid-fastbacillus）。
6、若系食管周围淋巴结结核所引起，内镜下可见到食管壁压迫肿胀，管腔有狭窄现象；如食管周围淋巴结结核已破溃入食管，则可见于酪样物和坏死肉芽组织。
7、如检查时病变已经愈合，则可见到不同程度的瘢痕和狭窄。
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