脂溢性角化病组织病理呈多种不同的表现。通常分6型，即角化型、棘层肥厚型、菌落型、腺样型、刺激型和黑棘皮型。同一损害中，常见不止一型的上述类型。
上述各型均有角化过度、棘层肥厚与乳头瘤样增生。绝大多数病例，棘层肥厚完全是由于肿瘤向上伸展，因此肿瘤下端平坦，与两端正常皮肤位于同一水平线上，为本病组织病理学特点。增生的瘤组织由鳞状细胞和基底样细胞组成，前者与正常表皮中所见的鳞状细胞相同，而后者比正常基底层细胞小，胞核相对较大。兹将上述六型分述如下：
1、棘层肥厚型 为本病最常见的类型，角化过度和乳头瘤病常轻，但表皮显著增厚。有些病例中增厚的表皮虽然只包绕着狭窄的乳头。另一些病例则可见由增厚、交织的表皮细胞索围绕结缔组织岛而构成的网状外观。可见很多角质凹陷在横切面上表现为许多假性角囊肿，此外亦见呈骤然而完全角化的真囊肿。在显著增厚的表皮中，基底细胞的数目超过鳞状表皮。此型黑色素含量较正常者多。
2、过度角化型 也称指状或锯齿型，角化过度和乳头瘤样增殖明显，但棘层肥厚不大明显。很多表面被覆表皮的真皮乳头，向上呈指状伸展，好像教堂的屋顶。表皮大部分由鳞状表皮组成，但到处可见小簇基底样细胞。一般无大量黑色素。
3、腺样型 表皮呈许多细的表皮细胞束从表皮伸向真皮并分支和交织，很多束仅由双层基底样细胞组成。纯网状损害无角质囊肿和假角质囊肿。但腺样型也常伴有棘层肥厚型，后者常见角质囊肿和假角质囊肿。腺样型的基底样细胞常见明显色素增加。
4、菌落型 表皮内有极显著的细胞巢，后者在有些病例中因胞核小而深染，只在少数部位见到细胞间桥，而与基底细胞上皮瘤的病灶相似。有些病例细胞巢则由有明显细胞间桥的相当大的细胞构成。