在使用抗生素期间或停用抗生素后短期内，特别是在应用林可霉素、氯林可霉素后，突然出现无红细胞的粘液腹泻或腹部手术后病情反而恶化，并出现腹泻时应想到本病。通过乙状结肠镜检查，见到伪膜及粪中细胞毒素测定阳性可迅速获得诊断。
1、实验室检查
周围血白细胞增多，多在10，000～20，000／mm3以上，甚至高达40，000／mm3或更高，以中性粒细胞增多为主。粪常规检查无特异性改变，仅有白细胞，肉眼血便少见，有低白蛋白血症，电解质失平衡或酸碱平衡失调。粪便细菌特殊条件下培养，多数病例可发现有难辨梭状芽孢杆菌生长，粪内细胞毒素检测有确诊价值。将患者粪的滤液稀释不同的倍数，置组织培养液中，观察细胞毒作用，1∶100以上有诊断意义，污泥梭状芽孢杆菌抗毒素中和试验常阳性。
2、内镜检查
在高度怀疑本病时，应及时作内镜检查，本病常累及左半结肠，而直肠可无病变，乙状结肠镜检查是重要的诊断手段之一。如病变在右半结肠，则需用纤维结肠镜检查。如在初期未发现典型病变者尚需重复进行内镜肉眼观察，在早期或治疗及时者，内镜可无典型表现，肠粘膜可正常，或仅有轻度充血、水肿。严重者可见到粘膜脆性增强及明显溃疡形成，粘膜表面覆有黄白或黄绿色伪膜。
3、X线检查
腹部平片可显示肠麻痹或轻、中度肠扩张，钡剂灌肠检查可见肠壁增厚、显著水肿、结肠袋消失，在部分病例尚可见到肠壁间有气体。此征象为部分肠壁坏死，结肠细菌侵入所引起，或可见到溃疡或息肉样病变表现。上述X线表现缺乏特异性，故诊断价值不大。空气钡剂对比灌肠检查可提高诊断价值，但有肠穿孔的危险，应慎用。