专家指出：膀胱结石的治疗方式需要根据两个方面选择。一个是发病的部位，一个是区别是否是原发性膀胱结石，结石疾病在治疗上，区分是否为原发是重点。但无论是哪种治疗方式，对于病因方面的确诊都不能忽视。下面就治疗膀胱结石的方式进行介绍：
1.腔内手术对直径较小、质地较疏松的结石可采用经尿道膀胱镜下碎石术。碎石的方法有机械、液电、超声、气压弹道、激光等。可根据医疗单位具体器械条件及操作者的喜好自行选择。由于器械直径过大，容易造成尿道黏膜损伤，故所谓的“大力钳”碎石已很少被使用。目前，临床上使用最多的是气压弹道碎石和钬激光碎石。术者需加强对术式操作的熟练度，避免不必要的损伤;术中尽量击碎结石并将结石碎片冲洗干净。一般残余结石直径为1～2mm即能确保其自行排出;术后需加强抗感染治疗，同时嘱患者多饮水以促进结石排出。
2.体外冲击波碎石ESWL：对直径为1～2cm的结石，可在俯卧位下行ESWL治疗。但由于膀胱容量体积较大，结石活动度较上尿路明显增加，术中较难聚焦定位，碎石效果难以确定，目前较少采用。
3.开放手术：对结石较大或需同时处理膀胱其他疾病者，可行耻骨上膀胱切开取石术。其指征是：①儿童膀胱结石;②结石体积过大;③合并前列腺增生症或尿道狭窄等需要开放手术治疗时;④膀胱憩室内的结石，尤其是巨大膀胱憩室者;⑤合并需要开放手术治疗的膀胱肿瘤;⑥在膀胱异物基础上生长的结石;⑦因为种种原因无法进行腔镜手术者等。
4.纠正结石的成因：膀胱结石的最大病因见于下尿路梗阻如前列腺增生、尿道狭窄、膀胱颈部抬高等，因此对于明确梗阻所致结石者应同时治疗梗阻性疾病。异物所致结石者应在取出结石的同时一并取清异物。控制尿路感染、加强营养对于抑制结石复发也具有明确的意义。如为神经源性膀胱等无法纠正的原发疾病，可视具体病情及患者自身意愿决定是否行耻骨上膀胱造瘘术。另外根据结石成分分析结果应用类似碱化尿液、抑制尿酸等药物，同时养成大量饮水、低钙饮食的生活习惯亦能预防结石复发。