农民肺实验室检查有的对鉴别意义不大。例如痰中能否查找到或培养出嗜热放线菌对临床诊断没有参考价值，因为大量抗原吸入在人体起到诱发变态反应的作用，在37℃体温的情况下并不繁殖，痰中找到少量嗜热放线菌也不一定致病，一般认为血清中出现抗嗜热放线菌(或其中某一亚型)的沉淀素抗体，结合病史可以诊断，但抗体阳性只能表示曾经感染过相应抗原，如不再接触抗原血清中抗体可在数年内消失，如长期反复小量接触抗原时血清中抗体可长期存在(例如生活在农民肺流行区的非农业工作者)，并不代表发病，我们的经验是查到嗜热放线菌的循环免疫复合物，对诊断意义较大，因为免疫复合物会在数月内消失。此外，其他检查特点分别如下：
激发试验
吸入嗜热放线菌孢子后4～8h发病是确诊的依据，但激发时可能有一定危险，如患者在自然环境下吸入了抗原而发病则可诊断。皮肤抗原试验亦可能产生严重不良反应，不宜常规使用。
X线胸片表现
急性期初始胸片上可无异常所见或仅有肺纹理增粗、紊乱，亦可在中三分之一肺野有小结节状阴影，边缘不清，直径约1mm至数毫米。随着病情加重，病灶密度增高，边缘清晰，急性型在脱离抗原后病灶可在数天或数周内消失，也可留有小结节病灶；重症病例可有大斑片状阴影，呈弥散分布；慢性型可见细小线条状或网状结节状阴影，也可有从肺门向外放射大条索状以及斑块阴影，以及蜂窝样透亮区形成和气陷征等肺间质纤维化表现。此时病变已难消退，病变多发于上中肺野，双侧不一定对称，偶有胸膜渗出，肺门淋巴结肿大、钙化、空洞，肺不张等，肺CT检查更易发现轻微病灶，如毛玻璃样影、小结节、线条样影或囊样变等，但价格较贵，宜于必要时进行。