（3）HBcAg与抗-HBc：HBcAg阳性提示存在完整的HBV颗粒，直接反应HBV活跃复制，由于检测方法复杂，临床少用，抗-HBc为HBV感染的标志，抗-HBcIgM阳性提示处于感染早期，体内有病毒复制，在慢性轻度乙型肝炎和HBsAg携带者中，HBsAg，HBeAg和抗-HBc三项均阳性，具有高度传染性，指标难以阴转。
分子生物学标记：用分子杂交或PCR法检测血清中HBVDNA，阳性直接反应HBV活跃复制，具有传染性。
3、丙型肝炎
丙型肝炎由于血中抗原量太少，无法测出，故只能检测抗体，抗-HCV为HCV感染标记，不是保护性抗体，用套式反转录PCR法检测血清HCV-RNA阳性示病毒活跃复制，具有传染性。
4、丁型肝炎
HDV为缺陷病毒，依赖HBsAg才能复制，可表现为HDV-HBV同时感染，HDAg仅在血中出现数天，随之出现IgM型抗-HD，慢性HDV感染，抗-HDIgG持续升高，自血清中检出HDV-RNA则是更直接，更特异的诊断方法。
5、戊型肝炎
急性肝炎患者血清中检出抗-HEVIgM抗体，恢复期血清中，IgG抗体滴度很低，抗-HEVIgG在血清中持续时间短于1年，故抗-HEVIgM，抗-HEVIgG均可作为HEV近期感染指标。
6、庚型肝炎
RT-PCR技术可检测HGVRNA，是HGV早期诊断和监测病毒血症的有效方法，抗-HGV的IgM和IgG抗体目前尚未成熟，存在检出率低且与RT-PCR结果不相符等特点。
三、肝穿活组织检查
是诊断各型病毒性肝炎的主要指标，亦是诊断早期肝硬化的确切证据，但因为系创伤性检查，尚不能普及，亦不作为首选。