ApoE的生理功能：
①组成脂蛋白，是CM，VLDL，IDL和部分HDL的结构蛋白；
②作为配体与LDL受体和ApoE受体结合；
③具有某种免疫调节作用；
④参与神经细胞的修复。
ApoE基因突变可引起许多ApoE的异构体，目前已报道的有近20种，其中多数可伴随有高脂蛋白血症。
（8）载脂蛋白（a）[Apo（a）]：Apo（a）是构成Lp（a）的重要蛋白质，Lp（a）是一独立存在的脂蛋白系统，其脂质成分和LDL极为相似，而其蛋白质部分由ApoB100和一富含神经氨酸的糖蛋白即Apo（a）组成，在完整Lp（a）颗粒中二者以双硫键共价相连，其比例因人而异，可为2∶1，1∶2或1∶1，标准的Lp（a）颗粒中含有一分子质量约645kD的Apo（a）分子，Apo（a）是一高度糖化的蛋白质，其糖的含量较高，约为ApoB的6倍，Apo（a）约占Lp（a）蛋白组分的20％左右，1987年CeLean等首先应用分子生物学技术检测Apo（a）的一级分子结构，发现其分子质量为503kD，含有27个Kingle结构，约4529个氨基酸，进一步研究证明，Apo（a）与血浆纤溶酶原约80％左右有同源性，两者在染色体上的基因位点十分接近，均位于第6号染色体长臂上，基因位点的相近导致了二者的结构十分相似，现已证明，Apo（a）分子由3个结构域组成：疏水性信号肽，KringleⅡ（可以15～37重复制）和KringleⅣ。
Apo（a）的生理功能目前尚不十分清楚，但已有许多研究均提示血浆中Lp（a）水平升高是冠心病的独立危险因素。
（9）胆固醇酯转移蛋白：20世纪70年代中期有人发现，血浆无脂蛋白部分含有一种特殊的转运蛋白，能促进血浆各脂蛋白间胆固醇酯，三酰甘油和磷脂的单向或双向转运和交换，这类特殊转运蛋白称脂质转运蛋白（LTP），LTP包括3种成分：胆固醇酯转移蛋白（CETP），磷脂转运蛋白（PTP）和三酰甘油转运蛋白（TTP），也有人根据这类蛋白质对热稳定性的不同将其分为两种：LTP1（热稳定性）和LTP2（热不稳定性）。