1、分期不同
慢性肾功能衰竭的最后阶段就是尿毒症，两者分期不同。慢性肾功能衰竭(简称慢性肾衰)是一种常见的临床综合征。它发生在各种慢性肾实质疾病的基础上，缓慢出现肾功能减退而至衰竭。据统计，每一万人口当中，每年有1-1.5人发生此综合征。而尿毒症是进行性慢性肾功能衰竭的终末阶段。按肾功能损害的程度，可分四期，即肾功能代偿期、失代偿期(又称氮质血症期)、肾功能衰竭、肾功能衰竭终末期——尿毒症期。
2、临床症状不同
进入慢性肾功能衰竭，特别是进入肾衰竭期以后，临床症状较明显。例如消化系统有厌食、恶心、呕吐、口有尿臭味;神经系统有疲乏、头痛、头晕，重者嗜睡、烦躁、淡漠、惊厥、昏迷等;心血管系统有高血压、左心室肥大，心肌炎、心包炎、视力障碍，视网膜出血;造血系统有贫血、出血倾向;呼吸系统有代谢性酸中毒时呼吸深长，可有胸膜炎的症象;皮肤瘙痒伴色素沉着，水电解质平衡紊乱。而尿毒症时慢性肾功能衰竭的终末期，所以临床症状更加严重一些。通常慢性肾功能衰竭的血肌酐133umol/l至707umol/l之间，尿毒症患者的血肌酐在707umol/l以上。
3、进展方向不同
肾衰竭之所以发生是由于肾脏的健康肾单位受到损伤，功能也逐步丧失，随着病情的恶化，肾单位由损伤到损害，直至到凋亡，这个病理损伤过程就是肾脏纤维化进展的过程。肾衰竭治疗如果不是针对肾脏纤维化进行有效阻断，即使应用一些药物后出现临时性的病情好转，也只能说是一个假象，终极仍然会进展到尿毒症。此时的肾脏组织几乎全部瘢痕化，丧失了几乎所有功能。如果在仅仅出现血尿、蛋白尿的时候进行有效治疗，可以延缓阻断肾脏纤维化的进程，爱护残留的肾功能。
