病原体以病毒为主，可占源发上呼吸道感染的90％以上。细胞较少见。又病毒感染后，上呼吸道粘膜推动抵抗力，细菌可乘虚而入，并发化脓性感染。
1、常见病毒：自组织培养法问世以来，对病毒了解渐多，简述如下：
(1)鼻病毒(rhino virus)：包括100多种不同血清型，可致上感、支气管炎及中耳炎。冠状病毒(Coronavirus)也是上感的常见病原，但分离需用特殊方法。
(2)柯萨基(Coxsackie)及埃可(ECHO)病毒：此类病毒均甚微小，属于微小病毒(Picornavirus)均可引起呼吸道症状。
(3)流感病毒(influenza virus)：分甲、乙、丙三种血清型。甲型可因其抗原结构发生较剧烈的变异而导致大流行，估计每隔10～15年一次。乙型流行规模较小且局限。丙型一般只造成散发流行，病情也较轻。以上三型小儿呼吸道疾病中，主要引起上感，也可引起喉、气管、支气管炎、毛细支气管炎和肺炎。
(4)副流感病毒(parainfluenza virus)：分1、2、3、4四种血清型。Ⅰ型又称“红细胞吸附病毒2型”(HA2)，2型称“哮吼类病毒”Ⅰ型(HA1)，往往引起细支气管炎和肺炎，也常出现哮吼。4型又称M-25，似较少见，可在儿童及成人中发生上呼吸道感染。
(5)呼吸道全胞病毒(respiratory syncytial virus)：仅有一型，对婴幼儿呼吸道有很强的致病力，可引起小流行。1岁以内婴儿约75％左右可发生毛细支气管炎，30％左右可致喉、气管、支气管炎及肺炎等。2岁以后上述疾病渐少，5岁以后下呼吸道感染明显减少，仅表现为轻型上感。
以上所述后三类病毒均属于粘液病毒。在上呼吸疲乏感染中以副流感病毒、呼吸道合胞病毒及冠状病毒较为常见。
