1982年2月，郑魁山被调入甘肃中医学院（现甘肃中医药大学），任针灸教研室主任。1984年，郑魁山和其他同道一起创建了针灸系并任系主任。随后，郑魁山又被评为全国首批名老中医药专家学术经验继承工作指导老师、甘肃省首届名中医、国务院政府特殊津贴享受者。
在甘肃中医学院工作的28年中，郑魁山与其长子郑俊江一起带教的徒弟、研究生、学生，难计其数。期间，在卫生部和教育部的安排下，郑魁山带教了来自日本、美国等十余个国家的留学生共计1000余人。
1991年10月，郑魁山在北京出席了世界针联国际针法灸法现场交流会，当场演示了烧山火、透天凉针法绝技，令所有与会代表叹为观止。会议期间，日本中国医疗普及协会会长横山瑞生、东京后藤学园园长后藤修司、中国室长兵头明、东洋学术出版社社长山本胜旷等19人及美国部分针灸学者，都请郑魁山给他们扎针，亲自体会中国传统针法的奥妙，结果个个心悦诚服，齐口盛赞中国无愧于“针灸故乡”的称号。
郑魁山从事针灸教学与临床70余年，堪称真正的针灸临床家和教育家。他完善了“热补凉泻法”，首创“温通针法”，归纳总结出了“汗、下、清、吐、温、和、消、补”针灸治病八法，增补子午流注针法穴位至24个。他编写专著6部，撰写论文60余篇，为后人留下了探寻古典针法的宝贵财富。郑魁山还带领他的研究生用现代科学实验验证了传统针法的有效性和可靠性，所发表论文多次获奖。在繁重的教学、写作任务之下，郑魁山仍坚持每周出三次门诊，20余年中治愈患者近15万人，人们尊称其为“西北针王”。1995年，经中国科协和甘肃省民政厅批准，甘肃郑氏针法研究会成立，郑魁山任会长。
千年奥秘此中寻