一、组织病理改变
表皮呈乳头瘤样增生，棘层肥厚。表面有轻度角化亢进及角化不全。在棘细胞及颗粒层内可见空泡化细胞，细胞胞体较大，有一圆形深染的核，核周空泡化，淡染，在核膜及浆膜间有丝状物相连，使细胞呈猫眼状。空泡化细胞是尖锐湿疣的特征性所见，在棘细胞中、上层更为明显。真皮浅层血管周围中等密度浸润，以淋巴细胞为主，还可见浆细胞浸润。真皮乳头部血管扩张，乳头增宽，上延。
二、醋白试验
以3%～5%的醋酸溶液浸湿的纱布包绕或敷贴在可疑的皮肤或黏膜表面，3～5分钟后揭去，典型的尖锐湿疣损害将呈现白色丘疹或疣赘状物，而亚临床感染则表现为白色的斑片或斑点。醋白试验对辨认早期尖锐湿疣损害及亚临床感染是一个简单易行的检查方法。对发现尚未出现肉眼可见改变的亚临床感染是一个十分有用的手段。醋白试验简单易行，应作为尖锐湿疣患者的一个常规检查手段，有助于确定病变的范围，进行指导治疗。但醋白试验并不是个特异性的试验，对上皮细胞增生或外伤后初愈的上皮可出现假阳性的结果。
三、阴道镜检查(colposcopy)
阴道镜是特殊的放大镜，主要用于对宫颈阴道部黏膜的观察，可用于外阴及阴道上皮的检查。阴道镜可将宫颈表现放大20～40倍，对宫颈上皮的亚临床感染，癌前期病变的早期发现，早期诊断有很大帮助。患者在检查前24小时内应避免阴道冲洗及性交。宫颈以3%～5%醋酸溶液浸湿的纱布敷贴3分钟后以阴道镜检查将有助于发现HPV的亚临床感染。对境界清楚的白色斑片或斑点，应进一步取材作组织病理学检查。宫颈上皮内瘤样病变(cervical intraepithelial neoplasia, CIN)可分为3级。
四、细胞学检查
主要用于检查女性阴道或宫颈上皮有否HPV的感染。在被检部位刮取细胞并涂于玻片上，以95%酒精固定;常用巴氏染色法，镜下所见分为五级;Ⅰ级为正常;Ⅱ级为炎症;Ⅲ级为可疑癌;Ⅳ级为高度可疑癌;Ⅴ级为癌症。Ⅱ级又分Ⅱa及Ⅱb。Ⅱa系炎症细胞;Ⅱb涂片中除炎症细胞外尚含少许轻度核异质细胞。对涂片示Ⅱb的病例应随访，定期检查。为确定有否HPV感染，需用特异性抗HPV抗体，作组织化学染色或采用原位杂交技术。
五、聚合酶链反应(PCR)
取病变组织或可疑部位样品，提取DNA，利用特异引物对目标DNA予以扩增。引物可以是HPV通用引物，亦可以是针对某一型的特异引物。该法敏感性高，特异性强，但该方法应该在通过相关机构认可或认证的实验室进行开展。
尖锐湿疣会引发什么疾病
1.尖锐湿疣可以并发恶性变,流行病学资料表明,尖锐湿疣与生殖器癌之间有密切关联,有报道说明5%~10%的外阴,宫颈,肛周湿疣经过较长时期后可出现癌变和发展为原位癌和浸润癌,还发现15%阴茎癌,5%女性外阴癌是在原有尖锐湿疣的基础上发生的,许多实验研究也证明HPV,尖锐湿疣和生殖器癌三者之间是存在着因果关系的.
2.溃疡、出血：皮损增大、增多后，可引起局部的异物和不适感。由于发病的部位多在包皮内、尿道口、阴唇、阴道内、肛周等，这些部位容易受微生物感染，导致病变部位的溃疡、化脓、出血、疼痛和肿胀。
3.传染婴儿，影响生育质量：患尖锐湿疣的孕妇，在分娩时，通过产道的婴儿可能被传染，引起婴幼儿的HPV感染。这是比较严重的尖锐湿疣并发症
4.非生殖器部位的感染：通过直接接触或被与污染的物品的间接接触，可以导致眼结膜的乳头状瘤和口腔黏膜的乳头状瘤。
尿道内尖锐湿疣通常无症状,但脆性损害可引起血尿,很大的疣体则会引起尿路梗阻,婴儿和青春期的男女儿童可发生肛周湿疣,女性儿童可有外阴湿疣,喉部尖锐湿疣大多数病例报告发生在婴儿,主要由HPV6和HPV11引起,病毒传染途径是经胎盘,围生期或生后感染还不清楚,亚临床感染绝大多数生殖道肛门HPV感染是亚临床的,组织细胞学方法也仅能检出不到一半,更多的是核酸水平的亚临床感染。