真菌孢子进入正常人的气道后，完整气道黏膜上皮的屏障作用对吸入的真菌孢子起着重要的防御功能，将真菌孢子拒之体外，同时气道内的巨噬细胞的吞噬作用也在清除吸入的真菌及其孢子中起重要作用，因此真菌很少能够成为病原体。由于气道黏膜上皮的屏障作用有效地限制了真菌抗原与气道相关的淋巴组织接触。因此，血循环中针对真菌的特异性IgE水平通常较低、用双向免疫扩散法及ELISA-IgG滴定法测定沉淀素均阴性。而对于特应性素质的病人来说，当气道反复不断地接触真菌孢子或菌丝体抗原时，在气道巨噬细胞吞噬真菌的同时，气道内的免疫系统还将其作为外来抗原进行提呈处理，由此可以产生针对真菌的特异性IgE而导致气道的致敏，诱发呼吸道的变态反应致使哮喘发作。曲霉、青霉、芽枝菌、交链孢霉、木霉、毛霉、根霉、梨头霉、共头霉、担子菌及念珠菌等真菌孢子均可作为抗原而产生特异性IgE，并可引起气道变应性炎症。
真菌变应性哮喘的发病情况
1、发病概况：由于实验技术上的限制和无相应的诊断标准，目前国内外对真菌变应性哮喘的发病率尚未提出一种确切的数据。由于真菌过敏的临床表现比花粉过敏复杂得多，它不一定有明显季节性，各种真菌间的交叉反应又很高，其发病率统计，各地差异较大。北京地区医院通过真菌皮肤试验阳性率21％，国内有人报告真菌变应原皮肤试验阳性率高达70％。近年来各种职业性真菌变态反应的发生率增高，据美国人口统计局统计，美国农业人口总数在800万以上，其中1/4经常接触谷物，有1/2～3/4的病人在谷尘中暴露，由于存放过久的谷尘中含有较多的真菌，许多由此引起真菌性哮喘、急性或慢性农民肺等。我国农业人口数十倍于美国，且以手工操作为主，真菌变态反应必然是十分重要的问题。今后随着农业、畜牧饲养业、酿造及发酵业、食品加工、蘑菇种植、制药业的发展，以及生活环境中空调器的使用，密闭式建筑物的增多，均可能进一步导致真菌变态反应的增加。