肾小管间质性肾炎的治疗主要是全身应用糖皮质激素，常用的制剂为泼尼松，口服用量一般为1m/（kg·d），治疗时间为3周～12个月不等，治疗时间不宜过短，应在5～12个月为宜，迅速减药则易引起血清肌酐水平升高。
葡萄膜炎的治疗主要使用糖皮质激素和睫状肌麻痹剂滴眼剂点眼。对于双侧急性和严重的前葡萄膜炎，应给予地塞米松滴眼剂点眼，每小时1次，以后根据炎症控制情况逐渐降低点眼频度。如滴眼剂点眼治疗引起眼压升高，可调整点眼频度或使用副作用小的糖皮质激素，如氟甲脱氧泼尼松龙、rimexolone等，并给予抗青光眼药物点眼治疗。睫状肌麻痹剂通常选用2％后马托品眼膏，1次/d，以后随着炎症减轻，逐渐降低点眼频度。还可选用非甾体消炎药滴眼剂点眼治疗。
如果治疗效果不理想，可以考虑给予口服糖皮质激素治疗，一般剂量为30～40mg/d（泼尼松），早晨顿服，约1周后即可减量，治疗时间一般不宜过长，治疗中应注意此药的副作用。如果患者对糖皮质激素不敏感（此多为后葡萄膜炎患者），可考虑使用其他免疫抑制药，如苯丁酸氮芥0.05～0.1mg/（kg·d）、甲氨蝶呤（7.5～15mg/周）、环孢素3～5mg（kg·d）、硫唑嘌呤1～2mg（kg·d）等，这些药物可单独使用，也可联合应用。但在治疗过程中应定期进行肝、肾功能和（或）血常规等方面检查，以免引起严重的毒副作用。
中医辨证施治对于降低肾功能损害，促进肾功能和葡萄膜炎的恢复以及降低免疫抑制剂的毒副作用都有一定的帮助。