食管其他少见恶性肿瘤与食管鳞状上皮癌相似为吞咽困难和疼痛，晚期表现为恶病质，因肿瘤组织不同，症状的进展程度各异。
1、食管腺癌
文献报道食管腺癌占食管恶性肿瘤的0.46％～1.5％，发病率近年来有上升趋势，除发生于食管壁固有腺体或异位胃黏膜外，国外文献报道85％来自Barrett食管，因为8％～10％的Barrett食管发展成癌，国内国内Barrett食管较少见文献少有报道，食管腺癌源自食管黏膜的多潜能干细胞，这种观点可以解释其发病，主要表现吞咽困难，体重下降和胃食管反流症状如烧心，胸骨后上腹部疼痛等，淋巴结转移发生率高达50％～70％，其预后比鳞癌差。
2、食管癌肉瘤
癌肉瘤由癌和肉瘤两种成分组成，临床还可见于子宫，乳腺，甲状腺，咽等部位，食管癌肉瘤比较少见，不足食管恶性肿瘤1％，生长部位为食管中，下段，中老年男性较多，其症状也以吞咽困难为主，但由于其为带蒂肿物突向腔内，不影响食管全周，故吞咽困难程度较轻，进展较缓慢，后期也可出现胸骨后不适和疼痛，X线食管钡餐造影为典型的腔内型肿物，充盈缺损部食管腔明显扩张，表现为息肉型及浸润型，以息肉型较多见，瘤表面覆有萎缩的鳞状上皮，或有糜烂，在蒂和食管连接部的黏膜多粗糙不平，有糜烂，镜下可见肉瘤成分（有纤维肉瘤，平滑肌肉瘤或纤维组织细胞瘤等）在息肉或结节状肿物内，占肿瘤体积之绝大部分，仅15％肉瘤穿透肌层，癌成分局限在蒂的基底部食管黏膜处，与肉瘤成分相连，并不混杂，少数癌与肉瘤成分相混，但两者间无移行过渡改变，癌大部是较早的原位癌或早期浸润癌，也有侵犯肌层的，但少见侵透管壁，淋巴结转移少见，如发现转移都为鳞癌部分，手术预后较好，组织发生学有Virchow，Schild等主张的双重来源说，两种组织来的肿瘤相遇在一起名为邂逅瘤，或认为癌与肉瘤皆来自同一胚胎干细胞，以后分化成两种不同组织，故称之为结合瘤，还有的学者认为原发为肉瘤成分，相邻食管黏膜上皮受其刺激而癌变，称为合成瘤。