血吸虫病的临床表现复杂且多样化，根据病期早晚，感染轻重，虫卵沉积部位以及人体免疫反应而不同，临床上可分为急性、慢性、与晚期吸虫病以及异位损害。
一、急性血吸虫病
急性血吸虫病发生于夏秋季，以7～9月为常见，男性青壮年与儿童居多，患者常有明确疫水接触史，如打湖草、捕鱼、摸蟹、游泳等，常为初次重度感染，约半数患者在尾蚴侵入部位出现蚤咬样红色皮损，2～3天内自行消退，从尾蚴侵入至出现临床的潜伏期长短不一(23～73天)，但以1个月左右占大多数，起病较急，临床症状以及发热等全身反应为主。
1、发热：患者均有发热，热度高低、期限与感染程度成正比，热型以间歇型最常见，体温曲线呈锯齿状，临晚高热，伴畏寒，次晨热退盛汗，弛张热及不规则低热次之；稽留热少见，均为重型，患者一般无显著血症症状，但重型患者可有意识淡漠、重听、腹胀等，相对缓脉亦可见，故易误诊为伤寒，发热期限短者仅2周，但大多数为1个月左右，重型患者发热可长达数月，称为重症迁延型，伴有严重贫血、消瘦、浮肿，甚至恶病质状态。
2、过敏反应：有荨麻疹、血管神经性水肿、全身淋巴结轻度肿大等，荨麻疹较多见，约见于1/3患者，血中嗜酸性粒细胞常显著增多，具有重要诊断参考价值。
3、腹部症状：病程中半数以上患者有腹痛、腹泻，而排脓血便者仅10％左右，腹泻次数不多，有时与便秘交替，重型患者腹部有压痛与柔韧感，可有腹水形成。
4、肝、脾肿大：90％以上患者肝脏肿大，伴有不同程度压痛，尤以左叶肝脏为显著，黄疸甚为少见，约半数患者伴有轻度脾肿大。
二、慢性血吸虫病
在流行区占绝大多数。
1、无症状患者：慢性血吸虫病中以无明显症状者最多，仅在粪便普查或因其他疾病就医时发现。