免疫抑制药和抗癌药造成肾脏损害的主要临床表现因不同药物而异，主要临床表现有多毛，牙龈增生，血压升高，肝脏损害等；肾脏病变表现为轻，中度蛋白尿，管型尿，少尿，肾小管性酸中毒，氮质血症，电解质紊乱，高血钾，高血压及急慢性肾功能衰竭，以下为几种常见药物引起肾损害的表现。
环孢素引起肾损害
1、急性小管坏死：环孢素引起的急性小管坏死多发生在移植后初期，研究报道，环孢素治疗患者移植后无尿的发生率高，少尿-无尿时间长，接受环孢素治疗的同种肾移植患者发生的急性小管坏死，形态学改变缺乏特殊性，在少尿-无尿时间延长的病例，可见轻度弥漫性间质纤维化，在肾功能恢复后，部分病例间质纤维化可完全消失，少数病例可持续存在局灶性或弥漫性间质纤维化，伴随长时间肾功能受损，对于无尿时间延长的患者是否停用环孢素仍有争议。
2、小管毒性病变：环孢素的小管毒性病变是指短期环孢素治疗引起的小管损害，与长期应用环孢素引起的环孢素慢性肾病属于不同的概念，在环孢素治疗的同种肾移植患者，常规或细针活检均能见到小管细胞的几种形态学改变，包括巨大线粒体，小管细胞空泡形成和微钙化等特征性变化，但这些病变非环孢素毒性所特有，环孢素小管毒性的临床表现与功能性肾毒性相似，但小球滤过率下降更显著，奇怪的是无近端小管功能损害的表现，尿中溶酶体，N-乙酰葡萄糖苷酶排泄在正常范围，无范科尼综合征报道，小管毒性的出现是环孢素总体毒性的一种表现，因此可引导临床医师调整环孢素剂量，或停用与环孢素同时应用的其他肾毒性药物。
在临床实践中，十分重要的是早期鉴别诊断急性环孢素毒性和急性排斥反应，但有时比较困难，临床上，急性排斥反应常有尿量减少，发热，超声检查显示移植肾水肿，发生急性排斥反应的患者血肌酐增加比环孢素毒性反应迅速，尿钠排泄减少和尿蛋白排泄增加在急性排斥反应虽少见，但高度提示排斥反应，肾活检显示急性排斥时有弥漫性细胞浸润，而环孢素毒性反应有时伴有小动脉病变，但是在无排斥反应的，接受环孢素治疗的患者，炎症浸润并不少见，另一方面，巨大线粒体，小管细胞空泡形成和微钙化也可见于发生排斥反应的患者。