由于发作性睡病的病因不清，所以治疗该病主要是以对症为主。所以了解疾病的性质是十分重要的，患者应充分认识到治疗此病只是一个良性过程，不会发展得更为严重。药物治疗主要有两大类：
1.治疗白天嗜睡的苯丙胺类兴奋剂，主要是通过突触前机制增加单胺能的传递而抑制REM睡眠。
常用的药物有：利他灵，10～20mg，2～4次/d口服，国外最大剂量为80～120mg/d，对日间过度睡眠效果最好，尤其用于病初之治疗;苯丙胺(安非他明)，可加服匹莫林(异匹莫林)37.5mg，2～3次/d口服，以延长清醒期，增强安非他明的疗效;右苯丙胺(右旋苯丙胺)，50～60mg/d;去氧麻黄碱(甲基苯丙胺)，20～25mg/d;哌甲酯(哌醋甲酯)，10～20mg，2～3次/d;匹莫林，10～30mg，2次/d。
治疗本病的“金标准”药物为右旋安非他明。去氧麻黄碱( 甲基安非他明)作用最强，对用其他药物治疗无效的患者有一定疗效。兴奋剂治疗无效时，应采取两种办法：①测定苯丙胺( 安非他明) 血浆浓度。②睡眠潜伏期测定以明确是否确实无效。
2.治疗猝倒、睡眠瘫痪、入睡前幻觉的三环类抗抑郁药和SSRIs药物 可能通过阻滞去甲肾上腺素重吸收达到治疗作用。如普罗替林，2.5～20mg/d;氯丙咪嗪，25～200mg/d。
对于发作性睡病的治疗只是一个良性过程，不会发展得更为严重。患者不要产生过度的思想负担和恐惧心理。但发作性睡病可以影响患者的智力，有人认为发病年龄愈小，对智力的影响愈大。因此，一旦确诊应尽早治疗。