肺并殖吸虫病的临床表现亦多样化，潜伏期数天至20年，大多在1年内，按其侵犯的主要器官不同，临床上可分为4型：
1、胸肺型：肺为卫氏肺并殖吸虫最常寄生部位，咳嗽、血痰、胸痛最为常见，典型的痰为棕褐色可持续数年，如伴肺组织坏死则呈烂桃样血痰，当肺并殖吸虫移行入胸腔时，可引起胸痛，渗出性胸膜炎或胸膜肥厚，四川并殖吸虫引起胸痛，胸腔积液较多，而咳嗽血痰较少。
2、腹型：以腹痛、腹泻、肝肿大为主要表现，腹痛以右下腹痛最多见，轻重不一，可有腹泻棕褐色脓血便，里急后重，脐周有压痛，偶可扪及结节或肿块，虫体在腹腔移行可引起腹腔积液或广泛炎症粘连，四川并殖吸虫常侵入肝脏，在肝内形成嗜酸性肉芽肿。
3、结节型：以皮下或肌肉结节最多见，约20％的卫氏并殖吸虫病患者有此征象，多位于下腹至大腿间皮下肌肉，结节内可见成虫虫卵，嗜酸性细胞和夏科-雷登结晶，四川并殖吸虫病主要表现是游走性，皮下结节或包块，其发生率50％～80％，结节和包块1～6cm大小，好发部位为腹壁，其次为胸壁，腰背及大腿内侧。
4、胸型：多见于儿童与青少年，早期可有头痛、呕吐、脑膜刺激征和颅内高压表现，稍后有癫痫、幻视、感觉异常等定位症状，侵犯脊髓则有脊髓受压、下肢感觉、运动异常、尿潴留、截瘫等症状。