引起肠吸收不良的病因很复杂，在营养物质消化吸收过程中，任何环节出现故障均可导致吸收不良综合征。肠道对相同类型营养元素的吸收不良的原因也多不相同。因此，对于该疾病应进行全面的检查。
1.筛选试验（1）粪便pH测定：糖耐受不良儿新鲜粪便pH多＜6，且经常低于5.5（2）粪便还原糖测定：取新鲜粪便1份，加水2份混匀后离心，取上清液1ml，加入Clinitest试剂1片通过与标准卡比色，获得还原糖浓度≥0.5g/dl为阳性，新生儿＞0.75g/dl为异常。上述上清液也可加斑氏（Benedict）液后加热，测还原糖由于蔗糖不是还原糖，需将1份粪便加2份1N的HCl，加热后取上清液，此时蔗糖已被水解为单糖，可按上述方法再测还原糖。由于未被吸收的蔗糖常在结肠内已被细菌分解为还原糖，因此实际上常不需先加HCl水解，但如加酸处理后，粪糖比未处理时显著增加提示病儿有蔗糖吸收不良健康搜索。粪便中含有其他还原物质如维生素C可呈现假阳性。
2.糖-呼气试验：方法敏感、可靠、简便，且无创伤性，但需气相色谱仪测呼气中氢含量。人体本身不能产氢，呼气中氢乃由结肠内糖被细菌发酵所产生。正常人对绝大多数可吸收的糖类在到达结肠前可完全吸收而肠道细菌发酵代谢未被吸收的糖类是人体呼气中氢气的惟一来源，利用这一原理可测定小肠对糖类的吸收不良。摄入某种试验糖前后，测定呼气中的氢气或14CO2，摄入试验糖后如呼气氢升高或呼气14CO2降低表示对该试验糖吸收不良。可在晚间禁食8～12h后测呼气氢作为基数，随即口服待测糖2g/kg最多不超过50g有人主张将剂量减至0.25～0.5g/kg，以减少诱发糖耐受不良症状。每隔半小时收集呼气测氢含量，共2～3h。如氢总量超过空腹时基数值20×10-6ppm，可诊断为被测试糖吸收不良病儿用抗生素可抑制肠道细菌，可出现假阴性。