就目前来看，自闭症形成的原因在医学界还没有定论，有很多原因会造成脑部伤害而令患者产生自闭。例如在婴儿期由于受到脑炎、脑膜炎等疾病侵袭，使得脑部受到伤害而可能会令孩子患上自闭症。除此之外，还有哪些原因呢?
诱发自闭症产生的内在因素：
过去自闭症患者一直被漠视误解，只有非常严重的患者才能得到帮助。但也有专家表示，过度密集的筛检，可能有很多人会被无辜的贴上自闭症的标签。
1、脑部扁桃体也出现增大。这个脑区担当这样的角色，就是对各种环境、情感和社交行为中出现的各种危险因素进行评估。它的大小与自闭症患者的高度焦虑有关。研究显示，在看别人脸庞的时候，自闭症患者的扁桃体就会被激发，好像他们遭遇到了危险。
2、由于脑白质和大脑的联络索数量过多，额叶-负责高级推理的脑区，就会急剧增大。到2岁的时候，自闭症患儿的大脑的发育速度就非常不寻常，并且会出现一些叫人摸索不透的发炎迹象。
3、就像额叶一样，小脑也是脑白质数量过多。这个脑区在身体协调、动作计划安排以及参与事务活动方面中担当着重要的角色。对于自闭症患者来说，这些方面都很差。
4、胼胝体(胼胝体【译】：位于大脑半球纵裂的底部，连接左右两侧大脑半球的横行神经纤维束，是大脑半球中最大的连合纤维。)过小。这种组织韧带负责连结大脑的左右半球。不同脑区的活动在自闭症患者身上就表现为协调性能极差，不像和谐的交响乐，而是像即兴演奏的爵士音乐。
5、脑部的海马也比正常人的大10%左右。这个脑区对记忆至关重要。一种可能性就是，海马的结构变大，是因为自闭症患儿依赖记忆去解释一些情境，而正常人是用别的脑区来处理这些情境。
