怀孕39天时，由于妊娠囊偏小，进行人工流产可能存在风险，主要担忧是手术中可能发生漏吸，从而导致流产不完全，这种情况可能对健康不利，甚至需要再次进行手术干预。
一般而言，人工流产最合适的时间窗口是怀孕7周左右，相当于末次月经开始算起的大约49天。这一时期，妊娠囊的尺寸和位置非常适合手术操作，手术风险低，恢复速度相对较快。然而，若超过10周再行人工流产，手术难度及对身体的潜在危害均会提升。
对于不超过49天的早期宫内妊娠，药物流产是一种可选方案。它相对简便，无需手术介入，但在实施前必须获得医生指导，并通过B超检查确认妊娠位于子宫内，以保障安全有效。
无论是人工流产还是药物流产，前期的B超检查都是不可或缺的步骤。这项检查有助于确定妊娠囊的确切位置与大小，并排除宫外孕的风险，为制定合适的流产方案提供依据。
面对流产，无论是身体还是心理，都需要做好充分的准备。流产过程会对身体造成一定影响，术后强调休息与营养补充。心理层面的支持同样关键，患者可寻求家人、朋友或专业人士的帮助。
流产后的护理至关重要，包括充足的休息、避免重体力活动及性生活，至少在术后一个月内需如此，以防止感染。此外，大约流产后一个月，应进行复查，确保身体彻底康复。
怀孕39天时，直接进行人工流产并非首选，药物流产或许是一个考虑选项，但所有决定都应在医生的指导下做出，并且必须完成必要的检查，术后也应严格遵循医嘱进行恰当的护理和复查，以确保身体健康。