华北国医学院的办学宗旨是：“以科学方法整理中医，培养中医人才，绝不拘泥成法，唯一宗旨希望明先哲遗言，借助新医经验，为人群造福。”该学院坚持以医德和医术结合、中医和西医结合、理论和临床结合的“三个结合”为学校始终如一的办学方针，按近代教育模式设立董事会和教务机构，实行严格的教学和学籍管理体制。学制为四年，办学时间长达18年，入学人数约650人。
1935年，华北国医学院创办校刊《文医半月刊》，以培养学生理论和实践结合的能力，鼓励学生发表自己的观点，从而改变中医界只顾看病、不善总结的陋习。在1937年的《文医半月刊》上，施今墨云：“学问之道永无止境，取短见长学者本色。当此科学发达之秋，自应舍去吾国医学陈陈相因之玄说奥理，而走向科学化之途。无论中医、西医，其理论正确治疗有效者，皆应信任之，反之摒弃不用也。”
《文医半月刊》设有长篇专著、医学商讨、名医医案、医药问答、脉学讲座、外科启秘、幼科研究、药学研究、良方介绍、论坛、译作、杏林文艺、卫生常识等栏目。在《文医半月刊》上发表文章而较有影响的有彭子益的《中医系统学》（今名为《圆运动的古中医学》）原理篇、生命宇宙篇，以及第二届学生任冠民的毕业论文《医案概论》、医夫的《萧山今墨施氏医案》、朱壶山的《杂病论精义折衷》等，都是长篇连载。
1936年，国民政府公布中医条例，规定考试办法及立案手续。北京第一次中医师考核，施今墨与肖龙友、孔伯华、汪逢春并推为主考官，世称为“北京四大名医”。1938年，《华北国医学院毕业纪念刊》明确指出：“中医之生命，不在外人，不在官府，而在学术也。”
施门走出的中医大家