1. 新疆维吾尔自治区人民医院：该医院的泌尿男科为自治区临床重点专科，是全疆首批细分亚专业科室，涵盖了肿瘤、结石、前列腺与下尿路疾病、移植、男科、尿控、小儿泌尿等亚专科，各亚专科均为疆内领先水平。
2. 新疆医科大学第一附属医院：男科设有男性勃起功能障碍诊疗中心，是集医疗、教学、科研为一体的科室，主要研究男性不育、辅助生殖技术、严重少精子与无精子症等多种疾病，拥有男科专家门诊、男科普通门诊及先进的男科治疗设备。
3. 新疆医科大学第二附属医院：泌尿外科整体医疗技术水平在疆内处于前列，拥有狄激光碎石系统、尿流动力仪等高精尖设备，科室已开展体外冲击波碎石、输尿管软硬镜狄激光碎石术等各种常规及复杂的泌尿系手术。
4. 乌鲁木齐友善医院：是一家与国际接轨的男科病医疗中心，拥有多名经验丰富的男科医生以及高精的机器设备，是乌鲁木齐市乃至全省的男性疾病科学研究及医治技术专业产业基地，尤其在男性不育症方面有较高的学术地位和影响力。
5. 乌鲁木齐市中医院：是一所集中医、中西医结合于一体的二级甲等中医医院，男科科室历史悠久，享有一定声誉。在继承传统中医理论的基础上，融合现代医学理念，提供个性化诊疗方案，常用于治疗男性不育、勃起功能障碍等问题。
乌鲁木齐市男科医院众多，每家医院都有其独特的优势和特色。患者在选择医院时，应根据自身病情、医院的专业领域和医生的经验等因素综合考虑，选择最适合自己的医院进行治疗
