厦门眼科医院是集“医疗、教学、科研、防盲治盲”为一体的国家三级眼科专科医院，以“高起点、高设置”，立足厦门、面向海峡两岸、辐射东南亚。

医院具备先进的眼科医疗设备，包括：在华南地区首批引进的德国鹰视FS200/EX500飞秒激光近视手术系统、美国爱尔康LenSx飞秒激光白内障治疗仪、CENTURION智能超声乳化手术系统、Constellation微创玻璃体切割机、美国无创治疗青光眼PNT系统等。

医院十分重视科研、教学，目前已成为厦门医学院教学医院、漳州卫生职业学院实习医院、福建卫生职业技术学院临床教学基地，多个科研项目获市科技局、卫生局立项，相关论文在国家级杂志上发表。医院定期举办眼科学术会议及手术直播、国内外疑难眼病会诊，使许多疑难眼疾患者不出厦门即可享受国内专家的诊治。