青少年抑郁症的治愈率受病情严重程度、干预时机及治疗方式的影响，在早期规范治疗的情况下，临床缓解率可达60%-80%。影响预后的关键因素包括复发预防、药物联合心理治疗、家庭支持、社会功能重建以及长期随访。
发病初期介入治疗效果显著。首次抑郁发作的青少年在认知行为治疗配合舍曲林或氟西汀等抗抑郁药物的作用下，12周内症状缓解率比延迟治疗组高35%。早发抑郁症存在脑神经可塑性窗口期，前额叶皮层功能在青春期具有较强的代偿能力。
多模式联合治疗可提升20%的治愈率。艾司西酞普兰对青少年情绪低落有显著疗效，配合正念减压训练可以降低复发风险。对于有自杀倾向的患者，重复经颅磁刺激联合辩证行为疗法能快速稳定症状。
家庭功能改善可以使治愈率提高1.5倍。实施家庭系统治疗的家庭中，患者的症状复现率降低42%。父母参与的情绪管理训练和冲突解决技巧指导能够显著改善青少年述情障碍。
伴随焦虑或进食障碍时，治愈周期会延长。合并广泛性焦虑的抑郁症青少年需要联用度洛西汀与暴露疗法，平均需要6-8个月达到临床治愈。注意缺陷多动障碍共病患者则需加入托莫西汀调节神经递质。
完善的校园支持系统有助于提高长期预后。实施同伴支持计划的学校中，抑郁学生的复学成功率提升了60%。职业康复训练可以使缓解期患者的就业能力恢复至发病前水平的85%。
维持期内建议每周进行3次30分钟的有氧运动，并采用地中海饮食模式补充ω-3脂肪酸。建立症状早期预警机制，当出现持续睡眠紊乱或兴趣减退时应及时复诊。学校心理教师应每季度评估患者的社会适应能力，家庭治疗需持续至症状缓解后6个月。青少年抑郁症治愈后，认知功能完全恢复通常需要12-18个月，在此期间应避免高强度的脑力负荷。