目前批准产品均基于新型冠状病毒基因组中开放读码框1a/b（open reading frame 1ab，ORF1ab）、包膜蛋白（Envelope protein，E）和核衣壳蛋白（nucleocapsid protein，N）进行选择。不同产品的检测原理基本一致，但是其引物、探针设计存在不同，有单靶区段（ORF1ab）、双靶区段（ORF1ab、N蛋白）、三靶区段（ORF1ab、N蛋白和E蛋白）的检测和判读差别。一般检测位于病毒ORF1ab和N基因上的两个靶标，同一份标本需满足双靶标阳性或重复检测为单靶标阳性或两种标本同时满足单靶标才能确认SARS-CoV-2病毒核酸阳性。
检测流程
检测程序需要经过五个步骤，取样、留样、保存、核酸提取、上机检测。首先根据试剂盒说明书进行样本采集，样本类型包括咽拭子、鼻拭子、痰液、支气管灌洗液、肺泡灌洗液等。由于RNA易降解，因此，采集样本时使用无RNA酶的拭子和无RNA酶的储存管。获得患者样本后，需尽快进行检测，如无法立即检测需要进行低温封装，并送到专门的检测机构进行检测。检测机构收到样本后，对样本进行核酸提取，核酸提取试剂应使用批准产品说明书中指定的核酸提取试剂盒。最后是荧光PCR核酸检测，也就是上机器检测，将提取物进行荧光PCR扩增反应，需要70—80分钟。
二抗体检测
病毒侵入人体后，人体会产生相应的特异性抗体进行防御。免疫球蛋白是机体在抗原物质刺激下由浆细胞产生的一类能与抗原特异性结合的血清活性成分，根据分子结构和抗原特异性的不同，将免疫球蛋白分为五类：IgG、IgA、IgM、IgD、IgE。
抗原初次进入机体后，经过一定的潜伏期产生浆细胞并合成分泌抗体。最早出现的是IgM，但该抗体维持时间短、浓度低、亲和力较低，在血中持续数日至数周，是急性期感染的诊断指标；在IgM接近消失时，IgG的含量达到高峰，IgG产生晚，但浓度高、维持时间长、亲和力高，血清IgG阳性提示感染中后期或既往感染，当数月乃至数年再次接触相同抗原时，最初原抗体量稍有下降，可能是由于一部分原有抗体被再次进入的抗原所结合，从而暂时降低了抗体含量，但短期内抗体含量迅速增加，可能比原来抗体含量高数倍至数十倍，以IgG为主，在体内持续时间也长，IgM很少增加。
