6月24日，《自然·医学》在线发布来自葡萄牙官方的病毒基因序列组研究。该文有3个重要发现。
第一，当前多国传播的猴痘病毒可能拥有同一个起源，是2018-2019年非洲暴发猴痘疫情的一个特征明确的进化支，且极有可能是从2017年尼日利亚疫情所涉病毒持续传播和演变而来。
第二，相较于2018-2019年的病毒，当前传播的病毒出现约50处变异，超出预期的突变率。葡萄牙研究团队认为，这个数值“出乎意料得高”，可能代表着猴痘病毒进化加速。
第三，有些变异会使病毒更易传播。突变偏好性显示，有多处变异带有逃逸Apobec3蛋白酶的明显特征。Apobec3蛋白酶是一种宿主防御因子，会迫使病毒在复制时犯错，导致其自我毁灭。
5月30日，英国爱丁堡大学的演化生物学家安德鲁·兰博特 （Andrew Rambaut） 发布研究，也提出猴痘基因异常突变或源于人体APOBEC3蛋白酶编辑。
美国西雅图弗雷德·哈钦森癌症中心进化生物学家特雷弗·贝德福德 （Trevor Bedford） 指出，Apobec3蛋白酶变异的快速积累，表明猴痘病毒可能已经适应人作为宿主，更擅长在人际间传播。由此导致的结果是，猴痘暴发或变得更频繁、难以控制。
法国病毒学会副主席米莱娜·奥利亚斯特罗 （Mylène Ogliastro） 表示，猴痘感染病例越多，妇女、儿童的感染风险就越高。
需要警惕的是，儿童是猴痘感染后重症风险较高人群。据英国《每日电讯报》5月22日报道，英国首例儿童病例在确诊后，就被紧急送往重症监护室，后续治疗情况不详。
WHO表示，紧急委员会提出一系列会促使其重新评估猴痘疫情的条件。包括未来21天内报告病例数增速加快，疫情在国际间或国家内部严重扩散，发病率、死亡率和住院率增加，以及出现病毒反向溢出到动物种群的证据，病毒基因组出现显著变化等。
