上海儿童医院是由中国儿科泰斗、中国工程院胡亚美院士倡议创建，是一所集医疗、保健、康复、科研、健康宣教和管理为一体的儿童特色专科医院，大型儿童健康公益项目“六一健康快车”的项目医院; 同时是中国关工委事业中心“六一健康快车”闪亮星星计划(中国儿童心理障碍防治计划)执行组长单位，设有“六一健康”在线上海会诊中心。

上海儿童医院属于儿童专科医院，在上海又被称为“多动症医院”“抽动症医院”“自闭症(孤独症)医院”“遗尿症医院”“性早熟医院”“静安儿童医院”的称呼，被誉为静安做最美医院。

建院以来，六一儿童医院积极开展各种形式的国内外交流和合作，以发育行为儿科为重点，践行儿童价值医疗HMO，推行单元序贯管理(基因检测、高通量测序、生物信息分析、神经递质检测、五轴三维诊断;神经调控治疗;行为生物学治疗)对难治性儿童神经系统、精神心理及行为发育疾病进行综合干预治疗。多动抽动障碍专业组是一个发展迅速、充满活力的团队，在发育行为儿科诊疗领域具有丰富的临床经验，总体实力强，尤其在处理和解决久治不愈的抽动障碍方面处于国内领先地位，每年接治患儿近万人。医院曾派出专家前往美国、日本、德国等国家参观访问和学术交流，并多次接待世界各国的专业人士参观访问;先后多次举办国内、国际讲习班，这些工作大大促进了医院重点专业学术发展和医疗、科研水平的提高。

六一儿童医院依托“六一儿科价值医疗”整体学科技术优势，在与中科院基因所、中科院心理所等科研机构和十家专业学术团体密切合作的基础上，构建了“一个重点专业，四个亚专业”的学科格局，即以“发育行为儿科”为重点，儿少神经科、小儿内分泌、过敏反应、皮肤病门诊为亚专业的发展方向，初步形成科研与临床相互合作与渗透的构架。名医荟萃的多学科专家团队力求将我国中医儿科治疗疑难病症的偏方、单方和秘方及非药物治疗方法、行为生物学前沿技术整合为医院的特色医疗资源，发挥中医药与现代生物医疗技术在儿童慢病诊疗中不可替代的优势。医院多学科专家协作组采用的“APS生物调序微生态疗法”被业界誉为“儿童神经心理行为疾病诊疗的第二条终极途径”;所开展的“儿童神经心理行为疾病”分型诊疗、分层评估体系及分层分度治疗，取得了显著成效。

上海儿童医院设有“六一健康”在线上海会诊中心，一方面始终以信息化为手段，以精准医疗为纽带，顺应国家医改政策和医疗智能化发展趋势，通过线上多维度的会诊模式，有效缓解了线下就医压力，降低非医疗成本，减轻患儿家庭负担;另一方面，通过建立多学科、跨区域的专科联盟和在线评估确诊指导中心，轻松预约知名专家进行线上线下诊疗服务，真正实现了指尖上的儿童健康。儿童就医模式因此突破了时空地域的限制，医生能随时随地为孩子的健康“牵线把脉”，每个家庭通过“六一健康”在线服务平台都能轻松找到专业的就医指导和帮助。

上海儿童医院实行全天候专家门诊，简化诊疗流程，设有“星期三爱心门诊”、“周二发育障碍名医特诊日”、“周四心理障碍名医特诊日”、网上预约挂号，提供全方位、一站式、高品质的儿童医疗保健服务。一年一度的“胡亚美儿科医博会”，充满关爱的“闪亮星星计划”护航者行动、“六一健康大讲堂”进社区公益行动，密切了医院与社会关系，也将新型的儿童健康理念带给了更多公众。

六一儿童医院以“儿童乐园”式就医环境、差异化的服务亮点专注于儿科特色医疗保健服务，开设的“儿少精神科联合门诊”、“儿少神经科联合门诊”、“生长发育联合门诊”、“过敏反应门诊”、“中医儿科门诊”“血管瘤胎记门诊”等特色专科专病门诊，深受患儿与家长的青睐和欢迎。