1、眼眶皮样囊肿治疗：皮样囊肿增长缓慢，如无明显炎症现象，无功能及美容障碍，允许一定时期的观察。皮样囊肿在增长时期可能恶化，仍以及时治疗为宜。目前可供选择的最佳治疗方法是手术切除。原则是囊壁及囊内容完全摘除，保留眼眶正常结构和功能。由于肿物所在位置不一，手术进路也有不同。
位于眶缘的皮样囊肿，局部皮肤切开，肿物容易完整取出。位于肌肉圆锥外间隙者，虽有纤维条索与骨缝联系，前路开眶也可完整取出。长期存在的肿物，由于囊内液渗出，引起炎症反应，周围纤维组织增生，与提上睑肌粘连，应仔细分离，以免损伤肌肉或残留上皮组织引起复发。肿物位于肌锥内者，因被脂肪围绕，少有粘连，利用外侧进路取出肿物。手术切除比较困难的是位于骨膜下间隙的骨窝以内或呈哑铃形通过骨孔与颅腔、颞窝或鼻窦沟通的囊肿，囊壁在骨壁凹窝内，高低不平，且与骨缘处粘连紧密，一次完整切除比较困难，往往需从眶缘切开骨膜，向后分离，至骨窝缘分离囊壁，将内容吸除，然后刮除窝内囊壁，必要时凿开隐蔽凹窝，去除内容物。
操作过程中，如囊壁破裂，囊内容溢出，应立即将囊内液体吸净，并用大量盐水冲洗囊腔，防止囊内液体溢入眶内引起炎性反应。将骨窝相对的骨膜与其粘连的囊壁一同切除，骨窝内苯酚腐蚀，酒精中和，盐水冲洗。呈哑铃形的囊肿，应开大骨孔，一次切除。骨孔和难于分离的粘连处也应用苯酚腐蚀。对于瘘管形成者，除切除囊肿之外，还要切除瘘管周围坏死组织。对于骨窝凹陷较大，术后引起明显眼球内陷，应用硅海绵或Medpor雕刻成型植入眶内，有利于术后美容。
2、眼眶黏液囊肿治疗：黏液囊肿或黏液脓肿常要手术处理，并需作患侧鼻窦内容剜出。一旦额筛窦黏液囊肿诊断明确，最好的手术处理是通过眉区在内上眶缘和骨膜反折之间作内上侧开眶术切口。鼻窦黏膜要完全切除。变性骨质亦要除去，同时务必剜除鼻窦之内容，需与鼻腔之间打通并放置引流。操作技术随黏液囊肿部位而作必要的变化。例如一个单纯的筛窦黏液囊肿可作鼻侧切口，而一个额窦黏液囊肿则有必要作一个较大的鼻上方切口处理。若是额窦硬脑膜外黏液囊肿因黏膜与硬脑膜粘连，需协同脑外科手术。若是一个蝶窦黏液囊肿产生压迫性视神经病变，应尽早应用鼻窦镜手术处理。术前和术后要给予广谱抗生素避免继发性感染。手术时应给予细菌培养，随后根据培养结果调整抗生素。