隐睾是比较常见的先天性疾病，有的宝宝生下来就摸不到一侧睾丸，如果不积极治疗会出现如下并发症。
1、生育能力下降或不育
隐睾的主要病理变化是生殖细胞发育障碍，因此可导致生育能力下降或不育。双侧隐睾患者生育能力显著下降，如睾丸位置较高，由于病理损害严重，生殖细胞发育严重障碍可致不育。但若隐睾位置较低，经适当治疗后，可望残留部分生育能力。
2、先天性腹股沟斜疝
隐睾者约65％伴有先天性腹股沟斜疝。这是腹膜腔与睾丸鞘膜腔之间的鞘突管未闭合，肠襻降入阴囊内的鞘突腔内所致。几乎所有隐睾腹膜腔与鞘突间的鞘突管未闭合，当鞘状管口狭小时则不形成疝，有些患儿在生后几个月即发生较大疝，可压迫精索血管，使隐睾进一步萎缩，有些则发生斜疝嵌顿和绞窄，这些均须尽早采取手术治疗。一般情况下则待患儿稍大后与隐睾一并手术处理。
3、隐睾扭转
Wallenstein统计150例睾丸扭转病人中，有90例(60％)为隐睾患者。未降睾丸发生扭转的机会是阴囊内睾丸的21～53倍。其发病原因和机制不明，可能与睾丸引带或提睾肌附着异常有关。
4、隐睾损伤
由于隐睾常位于腹股沟管内或耻骨结节附近，位置比较表浅、固定，容易受外界暴力创伤。随着年龄增长，隐睾患者活动范围增大，创伤机会也随之增多。伤后睾丸易发生纤维变性，加速其萎缩。
5、隐睾恶变
隐睾患者发生睾丸肿瘤的机会，比正常睾丸大20～40倍。高位隐睾，特别是腹内型隐睾，其恶变发生率比低位隐睾约高4～6倍。腹内型隐睾其睾丸肿瘤发生率为22.7％，Campbell统计其恶变率高达48.5％，而腹股沟或外环处隐睾仅为6.8％。据临床观察，10岁以后手术者不能防止肿瘤发生，10岁以前手术可明显减少肿瘤的发生，3岁前手术则能避免肿瘤的发生。一般认为睾丸固定手术并不能预防恶性变的发生，即使早期手术，也不会逆转这种恶变倾向。但下降至阴囊的睾丸发生恶变后容易被早期发现。隐睾恶变的发病年龄多在30岁之后。其发病原因除睾丸自身因素外，还与局部温度、血运障碍、内分泌功能失调等有关。