慢性肝炎的特点就是反复出现肝脏炎症的加重和缓解，并且会出现多种并发症，乙肝的并发症最常见的有以下几种：
1、肝原性糖尿病
乙肝的并发症在临床表现与Ⅱ型糖尿病相似，不同点为肝原性糖尿病空腹时胰岛素明显增高而C肽正常。服糖后胰岛素明显升高而C太峰值仍较正常稍低。是因为肝脏对胰岛素灭活能力减低，促使胰岛素升高，另外胰高糖素在肝脏灭活减少，加以肝细胞上胰岛素受体减少，对胰岛素产生抗力，因而虽胰岛素升高而血糖仍高，同时C肽受肝脏影响少，故C肽不高，提示β细胞的分泌功能无明显异常。
2、脂肪肝
机制尚不清，这类乙肝的并发症特点为一般情况良好，单项ALT轻、中度升高，血脂增高，B型超声检查可见脂肪肝波形，确诊根据肝活检病理检查。
3、肝硬化
慢性肝炎发展为肝硬化，是肝纤维化的结果。这类乙肝的并发症是发生机制尚未完全阐明。尚见于亚急性、慢性重型肝炎及隐匿起病的无症状HBsAg携带者。
4、肝癌
HBV、HCV感染与之发病关系密切。以慢活肝、肝硬化发生肝癌者多见。也可见于慢性HBV感染未经肝硬化阶段发展为肝癌。其发生机制目前认为与HBV-DNA整合有关，尤其是X基因整合。
5、肝性脑病
肝性脑病，又称肝昏迷，或肝脑综合征，在乙肝的并发症是肝癌终末期的常见并发症。以中枢神经系统功能失调和代谢紊乱为特点，以智力减退、意识障碍、神经系统体征及肝脏损害为主要临床现，也是肝癌常见的死亡原因之一，约导致30％左右的患者死亡。