若b5R分子中某些关键部位的氨基酸被置换,不仅影响到酶的稳定性,而且影响其生物活性,如与底物NADH的亲和力明显减低(Km值增大),结果就会严重地影响其催化效率,合成的是丧失了活性的酶。这样,不仅会累及红细胞,而且使各种组织细胞内的b5R活性丧失,影响了重要的物质代谢。如神经髓鞘中脑苷脂和神经节苷脂的生物合成障碍,会造成神经系统发育不良。此类变异临床表现为Ⅱ型MetHb血症。利用基因工程和定点突变技术,可以在实验室中人工合成各种突变的酶,对其生物化学特性的研究也证实凡能导致Ⅱ型MetHb血症的突变酶,催化效率都有严重丧失。
另外,如表中所列,基因突变若影响了正确地表达,如mRNA拼接错误、提前终止、大片段遗漏等,也会表现为Ⅱ型MHb血症。