消化道出血可因消化道本身的炎症，机械性损伤，血管病变，肿瘤等因素引起，也可因邻近器官的病变和全身性疾病累及消化道所致。
(一)上消化道出血的病因
1.食管疾病 食管炎(反流性食管炎，食管憩室炎)，食管癌，食管溃疡，食管贲门粘膜撕裂症，器械检查或异物引起损伤，放射性损伤，强酸和强碱引起化学性损伤。
2.胃，十二指肠疾病 消化性溃疡，急慢性胃炎(包括药物性胃炎)，胃粘膜脱垂，胃癌，急性胃扩张，十二指肠炎，残胃炎，残胃溃疡或癌，还有淋巴瘤，平滑肌瘤，息肉，肉瘤，血管瘤，神经纤维瘤，膈疝，胃扭转，憩室炎，钩虫病等。
3.胃肠吻合术后的空肠溃疡和吻合口溃疡。
4.门静脉高压，食管胃底静脉曲线破裂出血，门脉高压性胃病肝硬化，门静脉炎或血栓形成的门静脉阻塞，肝静脉阻塞(Budd-Chiari综合征)。
5.上消化道邻近器官或组织的疾病:
(1)胆道出血：胆管或胆囊结石，胆道蛔虫病，胆囊或胆管病，肝癌，肝脓肿或肝血管病变破裂。
(2)胰腺疾病累及十二指肠：胰腺脓肿，胰腺炎，胰腺癌等。
(3)胸或腹主动脉瘤破入消化道。
(4)纵隔肿瘤或脓肿破入食管。
6.全身性疾病在胃肠道表现出血
(1)血液病：白血病，再生不良性贫血，血友病等。
(2)尿毒症。
(3)结缔组织病：血管炎。
(4)应激性溃疡：严重感染，手术，创伤，休克，肾上腺糖皮质激素治疗及某些疾病引起的应激状态，如脑血管意外，肺源性心脏病，重症心力衰竭等。
(5)急性感染性疾病：流行性出血热，钩端螺旋体病。
(二)下消化道出血病因
1.肛管疾病 痔，肛裂，肛瘘。
2.直肠疾病 直肠的损伤，非特异性直肠炎，结核性直肠炎，直肠肿瘤，直肠类癌，邻近恶性肿瘤或脓肿侵入直肠。
3.结肠疾病 细菌性痢疾，阿米巴痢疾，慢性非特异性溃疡性结肠炎，憩室，息肉，癌肿和血管畸形。
4.小肠疾病 急性出血性坏死性肠炎，肠结核，克隆病，空肠憩室炎或溃疡，肠套叠，小肠肿瘤，胃肠息肉病，小肠血管瘤及血管畸形。