小儿赖特综合征有90％患者在前驱感染后3～30天(多数在2周内)发病，首发症状以尿道炎居多，其次为结膜炎和关节炎。80％的患者有中～高度发热，每天1～2个高峰，多不受退热药影响，通常持续10～40天自行缓解，热退后多伴有关节炎消退。这些具体的临床症状如下：
一、泌尿、生殖系表现
该系统症状的发生率达90％以上，最常见为尿道炎，可有浆液性或浆液脓性分泌物。排尿时有烧灼感或剧痛，尿道口红肿，可并发膀胱炎。本病也可见龟头炎，发生率为23％～50％，表现为无痛性浅表糜烂，周围为环状红斑。起病时可仅为小疱，破裂后形成浅表糜烂。包皮的冠状缘及龟头附近也被波及，有时龟头炎可先于其他症状出现，或仅有龟头炎而无尿道炎。女性患者尿道炎较少见。
二、关节症状
关节症状在三联征中最为突出，发生率达90％以上，有剧烈疼痛及烧灼感，进而肿胀。关节炎多在病程第2周出现，从单关节受累发展至多关节，好发于负重的下肢关节，如膝关节及踝关节，也见于手指、足趾、腕、髋、脊柱关节。应用镇痛剂后数天内即可缓解，一般预后良好。据报道有5％残留足关节的永久畸形。
三、肌肉骨骼病变
除关节炎外，赖特综合征还表现有三种典型的肌肉骨骼病变。
1、腊肠指(趾):整个手指或足趾的弥漫肿胀，称腊肠指(趾)。
2、骨膜炎：尤其在跟腱或髌腱附着点的肿胀或触痛，跟骨底面和足底筋膜炎，常引起“痛性足跟综合征”。
3、骶髂关节炎：下背痛，多系骶髂关节炎所致，常为非对称性，经常并发韧带骨赘。
四、眼部症状
2/3的病例有眼部症状，眼结合膜炎是本病三联征之一。一般先从下眼睑开始，呈均匀平坦光滑略带紫色，轻度者可无症状，中度结膜炎患者眼内有沙砾感并有稀薄浆液性分泌物。在睑结膜及穹隆部呈均匀性炎症，局部充血可扩展至球结合膜部。重症病例有眼痛，畏光等症状及球结膜水肿。病变多为两侧性，80％患者的结膜炎在1～4周内自行缓解。此外，尚可见到角膜炎、巩膜炎、虹膜炎、虹膜睫状体炎、角膜溃疡等，角膜炎的发生率为3％～8％，眼症状可在数天或数周内消失。
五、其他症状
皮肤黏膜病变常见，皮疹初起为淡黄色水疱，继而破溃后形成溃疡，多发生于生殖器、掌跖、上腭、咽部。皮疹常结痂和上皮角化，口腔病变也可见于舌、颊、唇和软腭的黏膜。在悬雍垂及扁桃体周围可见进行性融合性红斑，舌面上见红色乳头或表浅糜烂。约10％患者可有心脏异常，如心肌炎或心包炎，心电图呈各个部位的传导阻滞。约1％患者有神经系统异常，常见者为多发性周围神经炎、暂时性偏瘫和脑膜脑炎。呼吸道病变占8％，可表现为肺部浸润病灶及胸膜炎，尚见腹泻、腮腺肿大等表现。