潜伏期2～26周，平均8周，常见下列临床类型和特点：
一、急性丙型肝炎
多起病隐匿，症状较轻，常见乏力或活动耐力下降，厌食，腹部不适等，约25％出现黄疸，多呈轻度，肝脏轻到中度增大，脾大少见，ALT可表现为单相或多相型增高，后种类型预示肝损害严重或易发展成慢性型，病程约3～6个月或更长时间，有明显转慢性化倾向，约40％～60％转为慢性肝炎。
二、慢性丙型肝炎
分型同乙肝，病毒血症可呈持续性或间歇性，以前者多见，自然痊愈的可能性极小，部分病儿可发展为肝炎肝硬化。
三、亚临床型丙型肝炎
为儿科常见临床类型，患儿无肝炎症状，常在体检或因其他疾病就医时发现肝炎病情，进一步追查病原方得以诊断，追问相关病史可发现有些患儿尚处于急性期，而有些已进入慢性阶段。
四、病毒携带状态
从无肝炎症状，定期随访也无肝脏大小和质地异常，ALT无升高，肝活检基本正常或呈轻微病变。
五、婴儿HCV感染的特点
1、显性感染：易出现黄疸，脾大较年长儿多见。
2、经母婴传播获得感染：婴儿可呈短暂的病毒血症，即在出生数月后病毒血症消失，抗HCV多随之阴转。
六、HCV与其他病毒混合感染
1、与HIV混合感染：对经母婴传播获得混合感染婴儿的研究表明，两种病毒有协同致病作用：HIV感染病情进展更快，HCV病毒血症水平显著增高。
2、与HBV混合感染：可加剧肝脏损害，增加发生重型肝炎和肝细胞癌的危险性，HCV复制常占优势。