对于患有糖尿病的牙周炎患者，应先了解其治疗情况以及病情是否已被控制。对于未被控制的患者，不可轻易进行复杂的牙周治疗。首先应积极控制血糖，并进行口腔卫生宣教，给予洁治、刮治、根面平整及消除牙周袋的治疗。对血糖控制得不好或伴有严重感染的患者。必须在龈下机械清创或牙周手术前与内科医师会诊，确定是否预防性给予抗生素或采取其他措施防止菌血症造成病灶感染。糖尿病患者存在胶原代谢障碍，而四环素类药物除了有抗生素作用外，还可抑制胶原酶、基质溶解素及其他基质金属蛋白酶活性，减少骨吸收，所以四环素与机械清创联合治疗糖尿病性牙周炎的疗效很好，多西环素（强力霉素）抗胶原酶活性更强，且不经过肾脏代谢，而糖尿病患者肾脏功能常已受损，故更适用于糖尿病患者，常用剂量为100mg/d，共2周。
对于糖代谢控制不佳或有严重并发症（如肾病）的糖尿病患者，一般只进行应急的牙周治疗，如急性牙周脓肿切开引流、局部冲洗上药等，同时给抗生素以控制感染。对经过积极治疗已控制血糖的糖尿病患者，在全身情况允许的条件下，对已存在的牙周病应积极治疗，尽量消除彻底牙周感染，并教会患者认真控制菌斑；可按常规施以牙周治疗，但应给患者饮食建议，以使牙周治疗前后及治疗过程中维持血糖平稳。就诊尽量安排在上午（早餐及服药后1.5小时），手术操作应轻柔以减少创面和创伤等。治疗过程中要观察有无低血糖出现，还应减轻其疼痛及紧张心情，因为内源性肾上腺素的分泌可能增加对胰岛素的需求。病情较重者可预防使用抗生素。对此类患者应特别强调自身的菌斑控制及定期复查，以维持疗效。有效的牙周系统治疗可使糖尿病患者的糖化血红素显著降低，胰岛素的用量可减少。