结核性脓胸多由于肺结核空洞或胸膜下干酪样病灶破裂，感染胸膜而引起，间或可由脊椎结核的椎旁脓肿直接蔓延所致，如不能及时治疗或治疗不当可导致一系列并发症的发生。常见并发症如下：
1、自溃性脓胸
本病是结核性脓胸常见的并发症。结核性脓胸的壁层胸膜破裂，自发排出其内容物，可进入许多部位，最常见的是胸壁皮下组织。CT 可同时显示胸腔内外的病变，均呈厚壁的包裹性积液，且可显示两者之间的瘘。
2、胸膜恶性肿瘤
结核性脓胸并发胸膜恶性肿瘤相对罕见，虽然其发病机理不明，但慢性炎症是最重要的因素，其病理学类型较多。诊断也相对较难。如出现以下征象可提示本并发症：
(1) 胸腔密度增高。
(2) 胸壁软组织肿胀，脂肪线模糊，或两者同时出现。
(3) 脓胸附近有骨质破坏。
(4) 钙化的胸膜广泛内移。
(5) 脓胸的腔内新发生气液平面。此时应行CT 检查，可发现脓胸周围有软组织密度肿物，增强扫描有强化。在诊断中应注意胸膜肿瘤与自溃性脓胸的鉴别，肿瘤常有坏死或退行性囊变，但CT 值可与脓胸相似，重要的是发现软组织肿块的外形,其壁的厚度不规则和腔内有软组织密度凸出影，可提示胸膜恶性肿瘤。有时CT 对胸膜恶性肿瘤亦难以作出明确诊断，但能提供活检的部位。
3、其他
除以上并发症外，慢性脓胸术后并发残腔积液、胸膜全肺切除术后残端瘘、顽固性窦道等也有报导。