间插血吸虫病应根据流行区具体情况，因时因地制宜进行防治。采取以灭螺与普治患者、病畜为重点，结合粪便与水源管理及个人防护的综合性措施。
1、控制传染源 在流行区进行普查，并对患者与病牛进行大规模同步治疗。应用吡喹酮扩大化疗以控制血吸虫病流行，可使患者数大幅度下降，这是整个防治工作中重要的一环，尤其在湖沼地区与山区经过连续3年后将有显著成效。耕牛血吸虫病可采用硝硫氰胺混悬液1.5～2mg/kg体重，一次静脉注射有良好疗效。
2、切断传播途径 灭螺前首先应查清螺情，建立螺情图，为提供灭螺规划的依据。在水网地区可采取改变钉螺滋生环境的物理灭螺，如土埋法等；在湖沼地区可采用筑坝、围垦、种植的方法；在居民点周围建立防螺带等。化学灭螺可结合物理灭螺进行，采用氯硝柳胺等杀螺药物，并可制成缓释剂，延长其灭螺的效果。但目前大多数灭螺剂虽然对农作物与人畜无害，但对鱼类有毒，应防止其水源污染。
3、加强个人防护，保护易感人群 关键在于宣传教育，引导人们重视自我保护，在流行区尽量避免与疫水接触，例如严禁儿童在河沟中戏水。湖沼地区因收割捕捞、打湖草等必须接触疫水时，应采取个人防护措施。例如以脂肪酸为基质，加碱皂化后，掺入氯硝柳胺(2％)和松节油制成防护剂，有杀死尾蚴作用；1％氯硝柳胺碱性溶液浸渍衣裤对尾蚴也有预防作用。