华支睾吸虫病可并发急性胆囊炎、胆管炎、胆石症、肝硬化、类白血病反应等，其具体并发症状如下所述。
一、胆囊炎、胆管炎、胆石症：华支睾吸虫成虫和虫卵可使胆道发生阻塞，加上成虫的机械损伤造成胆管上皮脱落，易继发细菌感染，引起急性胆囊炎、胆管炎、胆石症，出现相应的临床症状。
二、、肝硬化：据资料报道，华支睾吸虫病肝硬化发生率为0.55％左右。可出现肝脏肿大（以左叶为主）及肝功能减退、门脉高压症等临床表现。华支睾吸虫病合并的肝硬化如能早期诊治，预后良好。
三、肝癌：据统计（同一地区2000人）华支睾吸虫病患者合并胆管细胞癌者约为0.72％，肝细胞癌约为2.12％。
四、类白血病反应：感染可刺激宿主骨髓粒细胞大量增生，出现类白血病反应，白细胞可高达15万。骨穿检查符合噬酸性粒细胞增多综合征的骨髓象。驱虫治疗后可恢复正常。
五、异位寄生及异位损害： 华支睾吸虫病可寄生在宿主肝脏以外的其他器官，增加了该病的复杂程度和诊断难度。
1、胰腺华支睾吸虫病： 多伴随肝胆华支睾吸虫病。临床上常表现为急性或慢性胰腺炎、胆管炎、胆囊炎等。
2、肺部华支睾吸虫病： 极其少见，主要表现为发热、呼吸困难、咳嗽等。诊断主要依靠在痰、支气管刷镜或粪便中查到虫卵。