睾丸疼痛的治疗应在确定其病因的基础上进行对症治疗，一时查不出原因，则可做镇静和止痛的对症治疗。必要时可采用精索普鲁卡因封闭治疗，这样可以阻断神经痛的痛源和大脑痛觉中枢之间的恶性循环。有些人则把疼痛与手淫联系起来，整天背着沉重的内疚的思想负担。殊不知过度焦虑、过分把注意力集中在性的表现能力上反而会造成精神性阳痿等性功能障碍。
传统治疗睾丸疼痛的方法是使用抗菌素、止痛类药以及手术引流，这些方法各有利弊：
一方面，抗菌素、止痛类药只能缓解暂时的疼痛，治标不治本，效果不能立竿见影，而且长久服用，会让致病菌产生耐药性，副作用也大。
另一方面，由于该病常与尿道疼痛、前列腺疼痛同时存在，而尿道疼痛和前列腺疼痛又是较为难以治疗的感染性疾病，这就直接增大了睾丸疼痛的治疗难度。
(1)一般处理：卧床休息，局部热敷及抬高阴囊、做提肛等适当加强体育运动。
(2)抗菌素对病毒性睾丸疼痛无效，需采用中医辨证施治。口服氟呱酸，每次0．2g，每日3次；或泰利必妥，每次0．2g，每日2次，连用5-7日。静滴青霉素640万u/日，分早晚2次点滴，连用3~5日。青霉素过敏者可用乳酸环沙星注射液静滴，成人每次200mg，每12小时1次，疗程3-5日。也可肌注庆大霉素，每次8万u，每日2次，疗程3-5日。