阿米巴痢疾是由溶组织阿米巴原虫引起的肠道传染病，病变主要在盲肠与升结肠。临床上以腹痛、腹泻、排暗红色果酱样大便为特征。本病易变为慢性，并可引起肝脓肿等并发症。
寄生在人类结肠中的阿米巴原虫主要有四种，其中只有溶组织内阿米巴与人类疾病有关。溶组织内阿米巴原虫有两个种：一为致病型溶组织内阿米巴(entamoeba histolytica)，另一为共栖型迪斯帕内阿米巴(entamoeba dispar)，两者的形态虽然相同，但其抗原性、基因结构和致病性完全不同。后者为非侵袭性阿米巴，无毒力，感染后无症状；前者可致侵袭性病变，人类阿米巴病即是由致病型溶组织内阿米巴感染所致。
溶组织阿米巴有滋养体和包囊两种形态，唯包裹能传播疾病，它是原虫的感染型。慢性患者和无症状的包囊排出者通过粪便排出包裹，污染食物和水，人吃了被污染的食物，喝了被污染的水，就可致病。
中医认为，饮食不洁，虫毒内侵，蛰伏大肠，蕴蓄而生湿热，阻碍肠道气机，扰乱肠道血行，气血失和，肠络受损，虫毒湿热腐败气血，化为脓血，合污而下，遂成奇恒痢。湿热虫毒损伤肠络，外蒸肌肉，可有发热、便脓血、里急后重等症;若脾胃不健，正虚邪亦，常时发时止，迁延难愈。少数病人可因脾胃受损，运化迟钝，致肝失疏泄，虫毒壅滞于肝脏，使血肉腐败，发为肝痈。