咳嗽哮喘长期不愈可能由多种因素引起，包括呼吸道感染未彻底清除、过敏原持续暴露、气道高反应性未控制、用药不规范以及合并胃食管反流等。
细菌或病毒感染后遗留的气道炎症是常见诱因。支原体、衣原体等非典型病原体感染易转为慢性，导致气道黏膜持续充血肿胀。急性期未规范使用抗生素或抗病毒药物时，病原体可能潜伏于呼吸道纤毛上皮中，反复刺激引发痉挛性咳嗽和喘息。
尘螨、花粉、宠物皮屑等过敏原长期接触会持续激活肥大细胞释放组胺。这种Ⅰ型变态反应导致支气管平滑肌收缩、黏液分泌增多，表现为夜间加重的阵发性喘鸣。部分患者对冷空气、油烟等非特异性刺激也存在过度反应。
慢性炎症使气道神经末梢敏感性增高，轻微刺激即可诱发支气管收缩。这种病理改变与炎症介质如白三烯、前列腺素的释放有关，表现为咳嗽变异型哮喘或运动性哮喘，肺功能检查可见支气管激发试验阳性。
吸入性糖皮质激素需要持续使用4-6周才能显效，部分患者因担心激素副作用自行减药。短效β2受体激动剂过度使用会掩盖炎症进展，导致气道重塑不可逆。孟鲁司特钠等白三烯调节剂漏服也会影响疗效。
胃食管反流病患者夜间平卧时，胃酸刺激咽喉和气管引发反射性咳嗽。这种非典型表现占难治性哮喘的30%，可能伴有烧心、反酸等症状。胃酸蛋白酶还会直接损伤气道黏膜，加重支气管痉挛。
建议每日监测峰流速值变化，记录咳嗽发作时间与诱因。饮食避免辛辣刺激及过甜食物，睡前3小时禁食可减少反流。环境控制需定期清洗床品并使用除螨仪，冬季外出佩戴口罩。适度的游泳、太极等运动能改善肺功能，但需避免剧烈运动诱发喘息。症状持续超过8周或出现咯血、消瘦时需完善胸部CT和支气管镜检查。