早晨咳嗽伴有黄痰可能是由慢性支气管炎、鼻后滴漏综合征、肺炎、支气管扩张或上呼吸道感染引起的，通常与夜间分泌物积聚和细菌感染有关。
长期吸烟或空气污染刺激可导致支气管黏膜慢性炎症。夜间平躺时，分泌物容易滞留，晨起后通过咳嗽排出黄痰。此时的痰液可能较为黏稠，并伴有胸闷感。急性发作期需要使用抗生素治疗，日常生活中应戒烟并避免冷空气刺激。
鼻炎或鼻窦炎患者夜间鼻分泌物倒流至咽喉，晨起时会刺激咳嗽反射从而排出黄痰。这种情况还可能伴有鼻塞、咽部异物感等症状。可以通过鼻用激素或抗组胺药物控制原发病，睡前抬高床头有助于减少分泌物倒流。
肺部细菌感染会导致炎性渗出物增多，经过一夜积累形成黄脓痰，常伴随发热、胸痛等症状。肺炎链球菌是最常见的致病菌之一，需根据痰培养结果选用阿莫西林、头孢呋辛等抗生素进行治疗，重症患者需要住院治疗。
支气管结构破坏会影响分泌物的清除，晨起后咳嗽排出大量黄绿色脓痰，有时甚至带血丝。铜绿假单胞菌是常见的感染源之一，需长期使用黏液溶解剂如乙酰半胱氨酸，并在急性期采用抗生素治疗。
感冒后期细菌继发感染也可能引起黄痰，多由溶血性链球菌引起。这种情况下通常还会出现咽痛、鼻塞等症状，但一般不会超过两周。如果痰量明显增加或持续发热，则需要进一步排查是否存在肺炎，通常选择青霉素类抗生素进行治疗。
建议每天喝1.5-2升的温水来稀释痰液，早晨起床前先侧身轻拍背部以促进排痰。饮食上应避免辛辣刺激的食物，可以多吃一些润肺食材如白萝卜和梨子。如果连续两周以上仍有咳黄痰的情况，应该去医院做胸部CT和痰培养检查。对于吸烟者来说，尽早去医院评估肺功能非常重要。保持卧室湿度在50%-60%之间，并定期清洁空调滤网以减少粉尘刺激。