亚临床甲状腺功能减退和临床甲状腺功能减退都是内分泌疾病，但两者之间存在明显差异，可以从病因、甲状腺功能表现、临床表现、治疗及演变结果等方面进行区分。
亚临床甲状腺功能减退通常由甲状腺功能障碍或甲状腺素分泌与释放障碍引起，导致甲状腺激素水平升高。而临床甲状腺功能减退的原因较多，会导致甲状腺激素合成与分泌减少，进而引起全身代谢功能下降。
在甲状腺功能表现方面，亚临床甲减的T3、T4水平正常，但TSH升高；相比之下，临床甲减患者的T3、T4水平降低，TSH同样升高。
亚临床甲状腺功能减退可能没有明显的临床症状，或者仅表现为轻微的血脂升高、疲劳等。而临床甲状腺功能减退则有更显著的症状，如记忆力减退、皮肤干燥、出汗减少以及食欲下降等。
关于治疗，亚临床甲状腺功能减退是否需要干预取决于多个因素，包括TPO抗体、TG抗体的增加程度、TSH异常情况、血脂水平以及临床症状等。相反，临床甲状腺功能减退一般需要长期口服替代疗法来控制病情。
如果不及时处理亚临床甲状腺功能减退，它有可能发展成为临床甲状腺功能减退。而未得到妥善管理的临床甲状腺功能减退可能会引发严重并发症，例如心力衰竭和心绞痛等。
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