疱疹性口腔溃疡与普通口腔溃疡的主要区别在于病因、症状特征及治疗方式。疱疹性口腔溃疡由单纯疱疹病毒HSV-1感染引起，表现为群集性小水疱破溃后形成溃疡；而普通口腔溃疡阿弗他溃疡通常与免疫、创伤或营养缺乏相关，多为单个圆形溃疡。
疱疹性口腔溃疡由单纯疱疹病毒初次感染或复发激活导致，具有传染性。相比之下，普通口腔溃疡的病因更为复杂，包括局部创伤如咬伤、维生素B12或铁缺乏、免疫异常或精神压力等，但无传染性。
在症状表现方面，疱疹性溃疡初期会出现成簇透明小水疱，破溃后融合成不规则溃疡面，常伴有发热和淋巴结肿大。普通溃疡则多为1-2个圆形或椭圆形浅表糜烂，边缘红肿，一般没有全身症状。
发病部位也有所不同。疱疹性溃疡好发于牙龈、硬腭等角化黏膜，并可能扩散至口周皮肤。普通溃疡多见于唇内侧、舌缘等非角化黏膜，不会累及皮肤。
病程长短上，疱疹性溃疡大约持续7-14天，病毒可潜伏在神经节中反复发作。普通溃疡通常7-10天自愈，复发间隔时间不定。
治疗方式上，疱疹性溃疡需要使用抗病毒药物如阿昔洛韦，配合局部镇痛措施。普通溃疡以缓解症状为主，可以使用氨来占诺口腔贴片或复方氯己定含漱液，严重时需糖皮质激素局部注射。
日常护理中，疱疹性溃疡患者应避免接触婴幼儿及免疫力低下人群，发作期单独使用餐具。普通溃疡患者需保持口腔清洁，补充富含维生素B族的食物如全谷物、瘦肉，避免辛辣刺激饮食。两种溃疡均需注意规律作息，若反复发作或溃疡持续超过2周未愈，建议到口腔科排查系统性病因。