一、病原体不同
引起普通感冒的病毒有很多种，其中以鼻病毒最常见（30％～50％），其次为冠状病毒（10％～15％）、呼吸道合胞病毒5％、副流感病毒5％、腺病韻＜5％和肠道病毒＜5％等；普通感冒主要发生在上呼吸道的鼻咽部，所以又可以称为急性病毒性鼻咽炎。它并不是很多人所想的细菌性感冒，从定义上来说，细菌性感冒并不存在，因此，单纯的感冒，在没有合并其他细菌性感染的情况下，是不需要抗菌药物治疗的。
引起流感的病毒主要有两种类型：甲型和乙型。根据病毒表面蛋白种类的不同，甲、乙型流感病毒又进一步分类为不同的亚型，如H1N1、H7N9等。它是一种由流感病毒所引起的传染性疾病，可累及呼吸系统，包括上呼吸道和下呼吸道。
二、表现症状不同
感冒的潜伏期大约为1天，起病不是很急，开始时鼻子和嗓子有些发干、发热和发痒，随后会出现鼻塞、流清鼻涕、咽喉疼痛、干咳和声音嘶哑等症状；有时还会有全身症状，如怕冷、疲倦、头痛和腰酸背痛、食欲不振等情况。体温一般不高，多数是低热，38℃左右，如合并继发性细菌感染，体温可能达到39℃左右。发病2-3天后，鼻涕量逐渐减少并转浓，咳嗽减轻，如果后期没有并发细菌感染，病程一般为5～7天，即可痊愈。
流感的潜伏期大约1~3天，起病大多急骤，全身症状较重而呼吸道症状较轻。开始表现为怕冷、发热，体温可高达39℃~40℃，头痛、咽干咽痛、全身酸痛、软弱无力。一般高烧要持续3-5天，而后体温才会逐渐恢复正常，其症状比普通感冒严重。流感是一种严重危害身体健康的呼吸道传染病，流感常见的并发症有肺炎、病毒性心肌炎和神经系统感染。如不及时治疗，流感亦会致命，并非言过其实。
